پیش بینی اپی توپ های B و T cell آنتی ژن P40 به منظور توسعه واکسن مایکوپلاسما آگالاکتیه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

آگالاکسی یک بیماری مسری در نشخوارکنندگان کوچک است که توسط باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه ایجاد می شود. پروتئین P40 از مهم ترین آنتی ژن های سطحی در باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه است، که می توان از آن به منظور طراحی واکسن نوترکیب استفاده کرد. هدف از مطالعه حاضر به دست آوردن ویژگی های بیوانفورماتیک آنتی ژن P40 بود. به همین منظور، طیف گسترده ای از نرم افزارهای آنلاین به منظور پیش بینی B و Tcell اپی توپ ها، ساختار دوم، سوم و آنتی ژنی سیته مورد استفاده قرار گرفت. روش های بیوانفورماتیکی مورد استفاده در مطالعه حاضر توسط مقایسه با نتایج چهار پیش بینی مختلف حاصل از کارهای آزمایشگاهی تایید شد. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی اسیدهای آمینه 24-40، 98-114، 218-240، 251-265 و 333-350 را برای B cell و اسیدهای آمینه 5-25، 86-105، 198-215، 143-153، 214-223 و 337-345 را برای T cell به عنوان اپی توپ نشان داد و مشخص شد تمامی B وcell T اپی توپ های پیش بینی شده بجز 5-25، 98-144، 141-157، 199-215 و 333-350 داری قدرت آنتی ژنی سیته می باشند. در نهایت، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک نشان داد که این مناطق به طور کامل داری خصوصیات اپی توپی بوده و می توانند برای توسعه واکسن نوترکیب مفید باشند.