تنوع نوکلئوتیدی نواحی ژنومی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای Lr29 و Lr47 در لاین های گندم نان (Triticum aestivum L.)

زنگ قهوه ای یکی از بیماری های مهم گندم است که خسارت زیادی به محصول آن وارد میکند. تولید ارقام مقاوم، روشی موثر، زیست محیطی و کم هزینه برای کاهش خسارت آن است. هدف این مطالعه، جداسازی و توالییابی ژنهای Lr29 و Lr47 انتقال یافته به گندم بترتیب از Agropyron elongatum و Triticum speltoides در هفت لاین گندم نان با درجات متفاوت مقاومت به زنگ قهوهای بود. با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی برای ژن Lr47، قطعه ای با طول 396 جفتباز با پنج چارچوب قرائت آزاد (ORF) در لاینهای مورد مطالعه تکثیر و توالییابی شد. دامنه ایجاد شده توسط این قطعه با 37 اسیدآمینه با پروتئین آگلوتنین جوانه گندم که یک پروتئین ضد میکروبی است 36 درصد همولوژی نشان داد. همردیف کردن این توالی با اطلاعات موجود در بانک اطلاعاتی NCBI بیانگر شباهت 99 درصدی آن با ژن ساکارز سنتتاز نوع یک گندم نان بود. تنوع نوکلئوتیدی ژنLr47 در لاین های مورد مطالعه برابر با 0041/0 برآورد شد. همچنین رقم حساس بولانی دارای یک فقدان بزرگ به اندازه 48 نوکلئوتید در انتهای ''3 غیر رمز کننده بود که آن را از بقیه لاینها متمایز میکرد. طول قطعه تکثیری ژن Lr29 برابر با 160 جفتباز بود که به ترتیب شباهت 91 و 90 درصدی با ژن استیل کوآنزیم A کربوکسیلاز گندم نان وAegilop stauschii نشان داد. در توالی این ژن 28 جایگزینی تک نوکلئوتیدی باتنوع نوکلئوتیدی 0589/0 وجود داشت. نسبت جایگزینی های همنام و غیرهمنام در ژنهایLr47 وLr29 به ترتیب نشان دهنده گزینش منفی و مثبت برای این ژنها در لاین های مورد ارزیابی بود.