بررسی عامل ارثی صرع غیر سندرمی اتوزومی مغلوب در یک خانواده ی ایرانی به روش توالی یابی کامل اگزوم

علت بیشتر موارد صرع ناشناخته است و عوامل ارثی می تواند در بروز آن نقش داشته باشد. امروزه، تحقیقات وسیعی در زمینه ی علل ایجاد صرع در حال انجام است. هدف از انجام این مطالعه، شناسایی ژن (های) عامل صرع غیر سندرمی با الگوی توارث اتوزومی مغلوب در یک خانواده ی ایرانی به روش توالی یابی کامل اگزوم بود.
مطالعه ی حاضر، از نوع تجربی بود. DNA ژنومی از خون سه فرد مبتلا و یکی از افراد سالم خانواده، استخراج و توالی یابی اگزوم با پلت فورم Illumina HiSeq 2000 انجام شد. ابتدا، دسته بندی واریانت ها از نظر نوع، جایگاه جهش و فراوانی آللی و سپس، اولویت بندی آن ها با دو رویکرد انجام شد. توالی یابی سنگر برای تایید واریانت NM_207111.3(RNF216): (g.5780794G>A)، (c.854C>T) ژن RNF216 انجام شد.
از 130855 واریانت، حدود 85 درصد از نوع تغییرات تک نوکلئوتیدی و 15 درصد از نوع indels بودند. یک سوم تغییرات در نواحی بین ژنی و اینترونی، یک سوم در 3’،5’UTR و یک سوم در نواحی اگزونی و جایگاه پیرایش بودند. از نظر فراوانی آللی در پایگاه داده ی ExAC و 1000 ژنوم، به ترتیب 8/3 درصد و 4/3 درصد واریانت ها، فراوانی آللی کمتر از 01/0 داشتند. با اعمال هر دو رویکرد، واریانت NM_207111.3(RNF216): (g.5780794G>A)، (c.854C>T) ژن RNF216 به عنوان کاندیدا شناسایی شد، اما ارتباط این واریانت در همه ی اعضای خانواده تایید نگردید.
توالی یابی اگزوم به ابزاری جهت مطالعه ی عوامل ژنتیکی بیماری های مندلی تبدیل شد، اما با محدودیت هایی نیز همراه بود. در صورت قرار گرفتن واریانت در نواحی غیر کد شونده ی ژنوم، هتروژنی کلینیکی، تشخیص نادرست بیماری، فنوکپی، محدودیت های تکنیکی و آنالیز واریانتی، می توانند موانعی برای شناسایی واریانت عامل بیماری محسوب شوند که باعث عدم موفقیت در شناسایی ژن عامل بیماری در این خانواده شده اند.