بررسی زیست داده ای ویژگی های ساختاری، عملکردی و دامنه میزبانی آنزیم های باکتریایی موثر در مقاومت به استرس های اکسیداتیو

گونه های اکسیژن فعال که می توانند از دو مسیر داخل وخارج سلولی منجربه استرس های اکسیداتیو و بیماری های ناشی از آن شوند، توسط برخی از آنزیم های باکتریایی قابل شناسایی و حذف می باشند. لذا پایش ساختاری، عملکردی و آشکارسازی دامنه میزبانی این نوع از آنزیم ها، ضمن ارائه راهکارهایی در جهت طراحی سازه های ژنتیکی، معرفی گونه های باکتریایی با قابلیت پروبیوتیکی را به دنبال خواهد داشت. به این منظور توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی ژن های katA،katE،*katE، sodA،sodA*،gshR، gshR1، gshR4، trxB1 و trxRاز بانک های اطلاعاتی استحصال، پایش ساختاری، عملکردی، ویژگی های فیزیکوشیمیایی، توپولوژیکی، و نیز دامنه میزبانی و قرابت یابی آنزیم های مرتبط صورت پذیرفت. نتایج حاصل از این تحقیق علاوه بر آشکارسازی ویژگی های فیزیکوشیمیایی، ترشحی بودن آنزیم های KATE، KATA، KATE* و SODA را آشکار نمود. پایش ساختاری این آنزیم ها ضمن معرفی دمین های عملکردی و مشترک با قابلیت حذف گونه های فعال اکسیژن، تجزیه پراکسید هیدروژن و تنظیم واکنش های اکسایش کاهش، دمین هایی با قابلیت تحریک پاسخ ایمنی و حذف آمونیاک را در برخی موارد نشان داد. در همین راستا بررسی میل اتصالی آنزیم ها به عوامل اکسیدان، میل بالای آنها به ویژه KATA به مولکول - O2را مشخص نمود. همچنین بررسی پراکنش میزبانی این آنزیم ها، حضور توالی های همگون به ویژه شبه توالی های مشابه باTRXB1 وTRXR با ارزش مناسب در گونه های مختلف از جنس های باکتریایی غیر میزبانی شامل Weissella،Pediococcus،Leuconostoc،Tetragenococcus، PeptoniphilusوListeria را مشخص نمود، که در این میان حضور 7 نوع توالی کدگذار با قابلیت احتمالی مقاومت به استرس های اکسیداتیو در محتوی ژنومی گونه های باکتریایی Pediococcus acidilactici، Lactobacillus pentosus و Lactobacillus plantarum آشکار شد.