شناسایی ژن های سیکلوتید در گونه های بنفشه و بررسی آثار ضدمیکروبی سیکلوتیدهای استخراج شده

سیکلوتیدها خانواده بزرگی از پپتیدهای گیاهی با فعالیت زیستی و ویژگی های ساختاری متمایز است که در خانواده های گیاهی روبیاسه ها، کوکوربیتاسه ها و ویولاسه ها بیان می شود. سیکلوتیدها به دلیل فعالیت های زیستی متعدد از جمله ضدویروس، ضدباکتری و ضدسرطان، همچنین ساختار منحصربه فردی که پایداری حرارتی و آنزیمی بی نظیری به آن بخشیده است، انتخابی مناسبی برای مهندسی پروتئین در کاربردهای دارویی و کشاورزی است.
در این پژوهش، استخراج ژن های کدکننده سیکلوتیدها از چهار نمونه گیاه بنفشه V. odorata، V. occulta، V. ignobilis، V. spathulata انجام شد. به منظور شناسایی ژنسیکلوتید، طراحی پرایمر و واکنش زنجیره ای پلیمراز صورت گرفت. همچنین، آثار ضدمیکروبی مجموعه سیکلوتیدها بررسی شد. برای رسیدن به این هدف از روش جزءگیری و استخراج با فاز جامد استفاده شد.
حضور ژن های سیکلوتید در گونه های مورد مطالعه به اثبات رسید. بررسی آثار ضدمیکروبی سیکلوتیدها نشان داد که از میان باکتری های بیماری زای انسانی استافیلوکوکس اورئوس بیشترین حساسیت را به پپتیدهای مورد مطالعه دارد و در بین مجموعه باکتری ها بیشترین حساسیت مربوط به سویه زانتوموناس اوریزوآ است، چرا که نقش ذاتی سیکلوتیدها در گیاه میزبان دفاع در مقابل آفات است.
به طور کلی، به نظر می رسد که احتمالا می توان از پپتید سیکلوتید حاصل از این گونه های بنفشه به دلیل وجود اثر ضدمیکروبی در مصارف دارویی استفاده کرد. همچنین، مطالعه توالی سیکلوتیدها نشان می دهد، علی رغم وجود اسید آمینه های حفاظت شده در اکثر سیکلوتیدها، تفاوت عملکرد در آن ها به دلیل تنوع توالی است.