ارزیابی کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تنوع ژنتیکی توده های گیاه دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare)

یکی از قدیمی ترین گیاهان دارویی رازیانه (Fueniculum vulgare) می باشد که در طب سنتی کاربرد فراوان دارد. در این تحقیق، تنوع ژنتیکی 16 توده ایرانی رازیانه تهیه شده از بانک ژن سازمان جنگل ها و مراتع با استفاده از 15 آغازگر SCoT (Start codon targeted) مورد ارزیابی قرار گرفت. آغازگر های SCoT در مجموع توانستند 77 باند تولید کنند که از این تعداد، 4 باند یک شکل مشاهده شد. آغازگرهای SC5 و SC29 به ترتیب با 10 و 9 باند بیشترین تعداد و آغازگرهای SC10، SC26 و SC44 با 2 باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. شاخص های محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC)، شاخص نشانگری (MI)، نسبت چندگانه موثر (EMR) و شاخص قدرت تفکیک (RP) برای کلیه نشانگرها محاسبه گردید که با توجه به شاخص های محاسبه شده آغازگرهای SC15 و SC63 به عنوان بهترین آغازگرها جهت بررسی تنوع ژنتیکی رازیانه معرفی گردید. میزان شباهت ژنتیکی مشاهده شده براساس اطلاعات این نشانگرها برابر 66/0 بود. بیشترین تشابه ژنتیکی در میان توده 6 (اردبیل 1) با توده های 7 (اردبیل 2) و 8 (تهران 1)، و کمترین تشابه را توده 15 (قزوین) با 5 (یزد) داشت. نتایج حاصل از گروهبندی تجزیه خوشه ایبه روش UPGMA بر اساس ضریب تشابه جاکارد توده ها در 4 گروه قرار داد که بر اساس تجزیه به مختصات اصلی (PCo) و تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) گروه های حاصل از تجزیه کلاستر تایید گردید بر طبق این گروه بندی واریانس بین گروه ها در سطح 5% معنی دار بود، اما براساس واریانس برآورد شده سهم واریانس بین گروه ها تنها 24 درصد از تنوع کل بود.