شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس با استفاده از روش ترادف یابی چند جایگاهی

مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس به صورت گسترده در محیط وجود دارند و عامل ایجاد کننده بیماری در حیوانات، پرندگان و بیماران نقص سیستم ایمنی و افراد سالم می باشد. هدف از این مطالعه به کارگیری روش ترادف یابی چند جایگاهی (MLSA) در شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس بود.
در این مطالعه، ابتدا توالی ژن های 16S rRNA، rpoB و hsp65 برای 8 زیر گونه از کمپلکس مایکوباکتریوم آویوم از بانک ژنی جمع آوری شد. سپس این توالی ها به وسیله نرم افزار clustalW2 هم ردیف شدند و براساس این ژن ها درخت های فیلوژنتیکی رسم شد. در نهایت، توسط نرم افزار CLC Main benchwork توالی مربوط به هر زیر گونه با هم ترکیب شد و درخت فیلوژنتیک با روش neighbor-joining رسم شد.
نتایج مبنی بر روش MLSA بهتر از مطالعه جداگانه ژن های 16S rRNA، rpoB و hsp65 بود.