شناسایی مولکولی ویروس پیسک توت فرنگی (Strawberry mottle virus) از مزارع توت فرنگی استان کردستان بر اساس منطقه 3 NCR

در تابستان 1397، علائم ویروسی شامل پیسک، بدشکلی و سوختگی حاشیه برگ ها از مزارع توت فرنگی استان کردستان مشاهده و تعداد 48 نمونه برگی جمع آوری شد. ابتدا برخی نمونه ها به گیاه محک Fragaria vesca</em> با استفاده از شته توت فرنگی (Chaetosiphon fragaefolii</em>) تلقیح و علایم مطابق با Strawberry mottle virus</em> (SMoV) ظاهر شد. سپس، آر ان ا کل از نمونه ها با روش سیلیکا استخراج و دی ان ا مکمل آن ها با آغازگرهای تصادفی شش تایی ساخته شد. PCR با آغازگرهای اختصاصی SMoV- Sm2ncr1a و SMoV-Smdetncr4a انجام و قطعه ای به طول 461 جفت باز در 28 نمونه از 48 نمونه فوق تکثیر گردید. به منظور اطمینان از نتیجه RT-PCR و بررسی مشخصات مولکولی، پنج جدایه براساس منطقه جغرافیایی، رقم میزبان و نوع علایم انتخاب و پس از الحاق به پلاسمید pTG-19 در باکتری Escherichia coli</em>انتقال و پلاسمیدهای نوترکیب همسانه شده تعیین توالی شدند. میانگین فاصله ژنتیکی در بین جدایه های در این تحقیق در سطح نوکلئوتیدی 002/0 ± 005/0 و با سایر جدایه های موجود در بانک ژن 008/0 ± 084/0 بود. مقایسه دوبه دوی توالی های نوکلئوتیدی نشان داد که بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی به ترتیب میان جدایه K3 با جدایه NSper51 از کانادا (015/0 ± 093/0) و جدایه SQA یا AG با جدایه NB926 از کانادا (007/0 ± 019/0) وجود داشت.این اولین گزارش از شناسایی این ویروس در مزارع توت فرنگی استان کردستان می باشد.