ارزیابی فیلوژنتیک برخی از گونه های زعفران ایران (.spp Crocus) به روش بارکد گذاری DNA

ارکدگذاری DNA روشی ساده برای شناسایی گونه ها با استفاده از یک توالی کوتاه ژنتیکی از یک بخش استانداردژنوم است. در این پژوهش سعی شد تا با بررسی تنوع کلروپلاستی و هسته ای و روابط فیلوژنتیک هشت گونه زعفران شامل چهار گونه بهارگل و پنج گونه پاییزگل با استفاده از ژنهای بارکد هسته ای و کلروپلاستی، مسیر تکاملی آن ها شناسایی و قرابت ژنتیکی آن ها مورد بررسی قرار گیرد. ابتدا PCR با آغازگرهای طراحی شده بر اساس بارکدهای کلروپلاستیmatK ،trnL و rbcL و بارکد هسته ای ITS انجام شد. سپس محصولات PCR خالص سازی و تعیین توالی گردید .نتایج حاصل از درخت فیلوژنی نشان داد که گونه های مورد مطالعه بر اساس توالی های بارکد های ITS ، matK و trnL از دیگر گونه ها تفکیک شدند. در بارکد rbcL روابط تعدادی از گونه ها بصورت حل نشده باقی ماند و این مکان ژنی به خوبی نتوانست تمایز بین گونه ها را ایجاد کند. ارکد ITS به دلیل قدرت تفکیک و تعداد SNP بالا و جامعیت در اکثر گونه ها، به عنوان بهترین بارکد معرفی شد. با وجود این، بارکدهای matK و trnL ،به عنوان بارکدهای مکمل شناسایی شدند. استفاده از چهار مکان ژنی موجب جدا شدن گونه های مورد مطالعه از یکدیگر شد. در مجموع فیلوگرام حاصل نشان داد که گونهhausskenechtii.-subsp-pallasii. C بیشترین شباهت را به زعفران زراعی نشان داد.