خصوصیات بیوانفورماتیکی خانواده ژنیWRKY درسورگوم

خانواده ژنی  WRKY رمز کننده گروه بزرگی از فاکتورهای رونویسی هستند که فعالیت ژن های مربوط به پاسخ گیاهان به تنش های زنده و غیرزنده را تنظیم می کنند. سورگوم (Sorghum bicolor) به دلیل تحمل منحصربفرد در برابر محیط های گرم و خشک، یک گیاه دانه ای و علوفه ای قابل توجه در مناطق نیمه خشک است. مجموعه ای متشکل از 85 ژن WRKY در ژنوم S. bicolor شناسایی و در سه گروه (I-III) طبقه بندی شدند. در بین اعضای گروه I ،SbWRKY13 نسبت به سایر اعضای این گروه، از یک موتیف انگشت روی متفاوت و جدید برخوردار بود. نتایج نشان داد که جهش در جایگاه های R ،K ،Y وQ در توالی حفظ شدهWRKYGQK رخداده است. بررسی تعداد کپی ژن ها نشان داد که هیچ تکثیر ژن کاملی پیدا نشد که نشان می دهد گسترش ژن SbWRKY لزوما بر اساس وقایع تکثیر ژن اتفاق نیفتاده است و یا اینکه تکثیر ژن های SbWRKY احتمالا در زمان های گذشته بوقوع پیوسته است. تجزیه و تحلیل خوشه ای نشان داد که تعداد ژن های روی کروموزوم ها با تعداد خوشه های ژنی ارتباط معنی دار دارد. بررسی ترکیب اسیدآمینه نشان داد که در کلیه گروه ها، آلانین و پرولین فراوانترین اسیدهای آمینه بودند در حالی که سیستیین کمترین فراوانی را داشت. بررسی ساختار اینترون ها نشان داد که اکثر ژن های SbWRKY در حوزه WRKY خود دو نوع اینترون فاز 0 و فاز 2 را داشتند. همچنین بررسی موتیف های حفاظت شده نشان داد که در گروه های IIa،IIb وIIc، شش موتیف شناخته شده در خارج از منطقه حوزه SbWRKY وجود داشت. نتایج تحقیق حاضر روند تکامل و تمایز عملکردی عوامل رونویسی WRKY را در سورگوم توصیف می کند.