تعیین ژنوتایپ گونه های آکانتامبا جداسازی شده از خاک شهرستان ورامین، ایران

خاک یکی از منابع مهم آلودگی انسان به آکانتامبا است. با توجه به افزایش موارد کراتیت آمیبی در سال های اخیر در ایران، توجه بیشتری نسبت به بررسی این آمیب در حال حاضر شده است. مطالعه حاضر با هدف جداسازی گونه های آکانتامبا با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) و تعیین ژنوتایپ های آنها در شهر ورامین انجام شد.

به طور کلی 18 نمونه از 12 پارک شهر ورامین جمع آوری شد. نمونه ها از فیلترهای نیتروسلولز 0/45میکرونی عبور داده شدند. پس از فیلترکردن نمونه ها، آنها روی محیط آگار غیرمغذی 1/5% همراه با باکتری اشریشیا کلی کشته شده کشت داده شدند. DNA ژنومیک با محلول DNG-plusTM از پلیت های مثبت استخراج شد و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی 18S rRNA با تکثیر قطعه 500جفت بازی به روش PCR مورد شناسایی قرار گرفت. نمونه های مثبت برای تعیین ژنوتایپ، تعیین ترادف شدند.

از 18 نمونه خاک، 6 ایزوله (33/3%) آکانتامبا، در محیط کشت از نظر مورفولوژی شناسایی شدند که از این تعداد 4 ایزوله (22/2%) با استفاده از پرایمرهای اختصاصی جنس آکانتامبا تایید شدند. ژنوتایپ تمامی نمونه ها T4 گزارش شد.

با توجه به این نتیجه، خاک پارک ها احتمال دارد یک عامل خطر برای افراد، مخصوصا کودکان در این منطقه باشد. از این رو، توجه بیشتری به نکات بهداشت عمومی توصیه می شود.