شناسایی ایزوفرمهای میکرو آر.ان.ای Let-7 در آزادماهییان با استفاده از داده های بیوانفورماتیک

میکروآر.ان.ای توالی های کوتاه غیر کد شونده ای هستند که تنظیم بیان ژنها را در مرحله بعد از رونویسی انجام می دهند، این نوع از آر.ان.ای غیر کد شونده در تنظیم بیان 60 درصد از ژنها دخالت دارند که درآزاد ماهیان تعداد بسیار محدودی از میکرو آر.ان.ای ها شناسایی شده است. لذا در این تحقیق به منظور شناسایی ایزوفرم های مختلف میکروآر.ان.ای Let-7 در آزاد ماهیان، داده های بیوانفورماتیک موجود در NCBI مورد استفاده قرار گرفت. 43 میلیون خوانش با طول حدود 22 باز مورد بازبینی قرار گرفت که از این مقدار 8/17 میلیون با Let-7 همخوانی داشتند، 9 ایزوفرم مختلف از خانواده Let-7 شناسایی شد که 8 عدد از آنها با ایزوفرم های شناسایی شده در سایر رده های جانوری تطبق داشته است و یک ایزوفرم جدید که دارای یک باز اختلاف با ایزوفرم Let-7f در آزاد ماهی اقیانوس اطلس (Salmo salar) است نیز شناسایی شد. ایزوفرم Let-7a نیز در میان 9 ایزوفرم دارای بیشترین فراوانی بوده است. برای 9 ایزوفرم شناسایی شده تعداد 20 لوکوس بر روی کروموزوم های ژنوم مرجع (Otsh.V1) در مرکز داده های NCBI شناسایی شد و بدین طریق مشخص گردید که تعداد 7 لوکوس بر روی ژنوم به صورت خوشه های ژنی از Let-7 می باشند، 2 لوکوس دیگر نیز برای ایزوفرم Let-7c بر روی قطعاتی از ژنوم مرجع که در کروموزوم ها مکان یابی نشده بودند شناسایی شد.