توصیف ریخت شناختی و مولکولی قارچ بیمارگر حشراتCordyceps farinosa و تجزیه و تحلیل تبارشناسی جنس بر اساس ترادف نواحی ITS-rDNA و -tubulinß
طی نمونه برداری از خاک، جدایه ای از قارچ های بیمارگر حشرات با استفاده از تله گذاری با لارو سن آخر Galleria mellonella جداسازی و با استفاده از ویژگی های ریخت شناختی و تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر ترادف های ناحیه ITS-rDNA و ß-tubulin طبق روش های بیشینه پارسیمونی ((Maximum Parsimony شناسایی شد. در کنار بررسی های ریخت شناختی و ریخت سنجی، نتایج تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنومی درستی شناسایی گونه، به نام Cordyceps farinosa را تایید کرد. در جدایه مورد بررسی، کنیدیوم ها با میانگین طولی 83/3 و عرض 98/1 میکرومتر و بیضوی و کنیدی زاها با میانگین طولی 98/4 و عرض 21/2 با گلوبوز عریض در بخش قاعده ای می باشند. طول قطعه تکثیر شده طی PCR برای ناحیه ITS، 615 و برای ناحیه ژنی بتاتوبولین 355جفت باز بود. در تمامی درختان تبارشناسی مبتنی بر هر دو ناحیه ژنی، C. farinosa KJ3 با جدایه C. farinosa CBS 541.81 در یک گروه تک نیایی قرار گرفتند. در درخت تبارشناسی مبتنی بر ترادف ITS-rDNA، گروه متشکل از C. albocitrina وC. coccidioperitheciata و در درخت مبتنی بر ترادف ژنی بتاتوبولین، C. confrogasa به عنوان گروه های خواهری C. farinosa ظاهر شدند. با هدف بررسی کارایی نواحی ژنومی مورد استفاده در مطالعات تبارشناختی جنس به صورت تنها و در ترکیب با هم، درختان تبارشناسی با گونه های مشابه ترسیم و از نظر شاخص ثبات، شاخص بازداری و توپولوژی با هم مقایسه شدند. توپولوژی درخت تبارشناسی حاصل از تلفیق هر دو مکان ژنی پلیتومی کمتر و وضوح بیشتری در بیان روابط گونه ها در مقایسه با درخت مبتنی بر ترادف ITS-rDNA داشت. در مجموع نتایج نشان داد که ترادف ناحیه ژنی بتاتوبولین در مقایسه با ناحیه ITS-rDNA از کارایی بیشتری در مطالعات تبارشناسی در جنس Cordyceps برخوردار می باشد.
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.