شناسایی چند شکلی های ژن HSP70A1A در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف با تکنیک PCR-SSCP

در اقلیم های مختلف، نقش مقاومت سلولی به استرس های ناشی از تغییر دما از طریق خانواده ای از پروتئین ها که اصطلاحا، پروتئین های شوک گرمایی (HSP) نامیده می شوند، کنترل می شود. در پژوهش حاضر، شناسایی چند شکلی های تک نوکلیوتیدی موجود در مناطقی از ژن HSP70A1A در گوسفند بومی نژاد مهربان و گوسفند وارداتی نژاد رومانف به جهت ویژگی این نژادها به سازگاری در اقلیم های سردسیری، بررسی شدند. در مجموع، تعداد 141 حیوان شامل گوسفند نژاد مهربان (100 راس) و گوسفند نژاد رومانف (41 راس)، به طور تصادفی انتخاب و مراحل خونگیری و استخراج DNA طبق دستورالعمل های متداول انجام شد. سپس، واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) جهت تکثیر اگزون ژن HSP70A1A (Oar_v4.0; Chr20, NC_019477.2) به اندازه 247 و 298 جفت باز انجام شد. همچنین، جهت تعیین چند شکلی نمونه ها از تکنیک PCR-SSCP و متعاقب آن، توالی یابی مبتنی بر سانگر استفاده شد. بر اساس نتایج SSCP، به طور مشابه در هر دو نژاد مهربان و رومانف تعداد 5 الگوی باندی مشاهده شد که قطعات تکثیر شده 247 و 298 جفت بازی به ترتیب دو و سه الگوی الکتروفوزی را دارا بودند. علاوه بر این، هیچ تفاوتی در فراوانی الگوهای مشاهده شده بین این دو نژاد گوسفند یافت نشد. همچنین، در این نژادها نتایج توالی یابی وجود تعداد 5 چند شکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) شامل g.26562252C>A، g.26562261G>C، g.26562270T>C، g.26562273C>T و g.26562279C>T در قطعه 247 جفت بازی و تعداد سه چند شکلی تک نوکلیوتیدی شامل g.26561745T>C، g.26561784C>T و g.26561877G>A در قطعه 298 جفت بازی شناسایی نمود. در مجموع، نتایج نشان داد که، همه چند شکلی ها به غیر ازg.26561745T>C  و g.26561877G>A به طور معنی داری خارج از تعادل هاردی واینبرگ هستند (05/0p<). به عنوان نتیجه گیری نهایی، با توجه به نقش پروتئین های شوک دمایی در مقاومت به استرس های محیطی، شناسایی این چند شکلی ها می تواند تاثیر بسزایی در درک مکانیسم سازگاری  به تحمل دمایی در نژادهای گوسفندان بومی ایرانی داشته باشد.