شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری لکوز (‏BLV‏) در گاوهای هلشتاین ایران‏

بیماری ویروس لکوز گاوی (BLV) یکی از بیماری های کشنده ویروسی است که هر ساله با ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت گاو شیری، همانند کاهش توان تولیدی و عملکرد تولیدمثلی حیوانات مبتلا و درنهایت حذف آن ها همراه است. هدف از اجرای این پژوهش شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به BLV در گاوهای هلشتاین ایران بود. به این منظور مجموع 152 حیوان برای 30105 جایگاه نشانگریSNP با استفاده از تراشه های GGP Bovine LD v4 تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده های اولیه در نهایت 23513 نشانگر SNP در 140 راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (68 راس) و بیمار (77 راس) گروه بندی شدند و بخش هایی از ژنوم که در این حیوانات به صورت واگرا هدف انتخاب قرار گرفته بودند با استفاده از آماره نااریب تتا مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج این تحقیق نشان داد که چهار منطقه ژنومی روی کروموزوم های شماره 1، 13، 20 و 22 در این حیوانات هدف انتخاب قرار گرفته اند. بررسی ژن های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این مناطق ژنومی، ژن هایی همانند ژن STGA1 در کروموزوم 1، ژن های STK35، EBF4 و PDYN در کروموزوم 13 و ژن هایی SLC38A3، RASSF1 و RBM6 در کروموزوم 22 شناسایی شده است. بررسی عملکرد این ژن ها نشان داد که این ژن ها در سیستم ایمنی و تنظیم چرخه میتوز و میوز و سرکوب سرطان نقش دارند. در مجموع نتایج این تحقیق می تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در جهت شناسایی مناطق ژنومی کاندیدا و یا ژن های سببی مرتبط با این بیماری فراهم آورد.