گزارش دو miRNA 383 و 380-3p به داشتن نقش در تمایز سلول های عصبی

مکانیسم پیچیده تمایز سلول های عصبی همیشه یک چالش بزرگ جهت شناخت جامع همه miRNA های دارای نقش در تمایز سلول های عصبی بوده است. از همین رو miRNA های زیادی در تمایز عصب شناخته نشده اند. به همین جهت استفاده از داده های حجیم با کمک علوم کامپیوتر راه حل مناسبی جهت بررسی همه جانبه miRNA های احتمالی دارای نقش در مکانیسم تمایز سلولی می تواند باشد. مطالعه حاضر با هدف یافتن miRNA های کلیدی در مکانیسم تمایز سلول های عصبی جهت درمان آسیب های عصبی با استفاده از سلول درمانی صورت گرفته است.

جهت متاآنالیز داده های ترانسکریپتوم، 5 دیتاست ماکرواری، مورد استفاده قرار گرفت. که 4 دیتاست مربوط به بررسی ژن های افتراقی و 1 دیتاست مربوط به miRNA های افتراقی بودند. نتایج بدست آمده ژن های افتراقی توسط دیتابیس های miRTarBase و TargetScan مورد بررسی قرار گرفت تا اینکه نتایج miRNA های بدست آمده با نتایج آنالیز miRNA های افتراقی مقایسه شد و miRNA 4 دارای بیان افتراقی معنادار در مسیر عصبی بدست آمد. سپس توسط ابزارهای Cytoscape شبکه های پروتیینی و مسیرهای زیستی (Biological Process) ترسیم شد.

نتیجه متاآنالیز 4 دیتاست ژنی، 443 ژن و حاصل آنالیز دیتاست miRNA 148 ،miRNA ، با بیان افتراقی بود. سپس miRNA 800 دارای برهمکنش با 443 ژن افتراقی از دیتابیس های miRNA بدست آمد که تنها miRNA 4 دارای اشتراک با miRNA 148 آنالیز شده، در تمایز سلول های عصبی گزارش شدند. که از این بین miRNA 2 در مطالعات گذشته دارای گزارش بوده و تنها دو 380-3p miRNA و 383 که در مطالعه حاضر که باقی مانده بودند گزارش شدند.

به نظر می رسد که دو miRNA 380-3p و 383 در تمایز سلول های عصبی دارای اثر باشند، در نتیجه جهت سلول درمانی و بهینه سازی تمایز سلول های عصبی در این مطالعه برای اولین بار کاندید می شوند.