بررسی توالی کامل ژن های فسفوپروتئین و ماتریکس ویروس نیوکاسل جدا شده از مزارع مرغ شمال شرق ایران

ویروس نیوکاسل از جمله عوامل بیماری زایی است که گونه های مختلف پرندگان را در سرتاسر جهان آلوده می کند. رخداد مکرر این بیماری در سال های اخیر و در نقاط مختلف ایران، خسارات اقتصادی قابل توجهی را به صنعت طیور کشور وارد کرده است. منطقه ی شمال شرق کشور از صنعت گسترده ای در زمینه ای بهداشت و پرورش طیور برخوردار است. بنابراین بررسی مداوم بیماری نیوکاسل در این منطقه، اهمیت بالایی در کنترل بیماری دارد.

توالی ژن فیوژن، حدت ویروس نیوکاسل را تعیین می کند. علاوه بر آن، اهمیت توالی ژن های فسفوپروتیین و ماتریکس نیز در تکامل و حدت ویروس ثابت شده است. علی رغم این اهمیت، تاکنون ارزیابی مولکولی این ژن ها در ایران بسیار محدود بوده است. در این راستا، توالی کامل ژن P و M جدایه ای از ویروس به عنوان معرفی از عامل همه گیری گسترده ی بیماری در شمال شرق کشور در سال 2011 را مورد مطالعه قرار دادیم.

پس از تکثیر و شناسایی، توالی نوکلیوتیدی و آمینواسیدی جدایه ی مورد مطالعه توسط روش های بیوانفورماتیکی مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین همسانی، ترکیب آمینواسیدی و ارتباط فیلوژنتیکی این جدایه یا سایر سویه های گزارش شده از ایران و جهان مورد مقایسه قرار گرفت.

سویه ی مورد مطالعه از نظر توالی ، بیشترین شباهت را به سویه های با ژنوتیپ VII.I.I گزارش شده از ایران و چین نشان می داد. بررسی های فیلوژنتیکی، این سویه را در کنار توالی های سال های 2011 تا 2019 گزارش شده از ایران و همچنین توالی های کشور چین قرار داد. با این حال، این سویه فاصله ی ژنتیکی بیشتری نسبت به سویه های واکسینال و دیگر ژنوتیپ های شناخته شده در جهان را نشان می داد.

به طور کلی، مطالعات ما نشان می دهد که علی رغم ظهور ژنوتیپ های جدید ویروس نیوکاسل در ایران، تحت ژنوتیپ VII.I.I این ویروس نیز همچنان در حال گسترش می باشد. علاوه بر این، شیوع پایدار ژنوتیپ های ویروس نیوکاسل در شمال شرق کشور، اهمیت مدیریت امنیت زیستی و مطالعه ی فعال بیماری در منطقه را یادآور می شود.