اولین گزارش رخداد ویروس شکست رنگ گل شمعدانی (PFBV) از ایران و تعیین برخی ویژگی های مولکولی آن

شمعدانی  (Pelargonium spp.) از جایگاه مهمی در صنعت گل و گیاه جهان برخوردار بوده و یکی از محبوب ترین گیاهان برای استفاده داخل و خارج از خانه است. بیماری های ویروسی نقش مهمی در کاهش کمی و کیفی این گیاه زینتی دارند. در این بررسی 72 نمونه مشکوک به آلودگی ویروسی با نشانه هایی مانند لکه های روشن حلقوی، سوخته و زرد روی برگ و شکستگی رنگ گلبرگ و همچنین گیاهان بدون نشانه از گلخانه های مختلف منطقه محلات و ورامین جمع آوری شدند. RNA نمونه های جمع آوری شده استخراج و در آزمون RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از آغازگرهای عمومی تیره Tombusviridae، یک قطعه DNA با اندازه 500 جفت باز (bp) از 21 نمونه تکثیر شد. با تعیین توالی قطعه یاد شده در دو جدایه ویروس و مقایسه با توالی های موجود در پایگاه داده های GenBank، وابستگی جدایه های یاد شده به گونه Pelargonium flower break virus (PFBV) یا ویروس شکست رنگ شمعدانی آشکار شد. دوباره آزمون RT-PCR  با استفاده از  جفت آغازگر اختصاصی Ch1/Ch2 تکثیر کننده قطعه ای به طول  bp1500 از قسمت انتهای 3' ژنوم PFBV شامل ژن پروتیین پوششی (coat protein, CP) روی نمونه های مورد بررسی انجام گرفت که درستی نتایج مرحله قبل را تایید کرد. قطعه تکثیر شده سه جدایه برگزیده، از ژل استخراج و به طور مستقیم تعیین توالی شدند. واکاوی فیلوژنتیک براساس توالی آمینواسیدی ژن CP جدایه های برگزیده انجام شد و درختواره فیلوژنی با استفاده از روش neighbor joining رسم گردید. نتایج بررسی های تبارزایی نشان داد که جدایه های PFBV گزارش شده از کشورهای مختلف در دو گروه قرار می گیرند و سه جدایه PFBV ایران در یک زیر گروه و جدا از زیر گروه های کشورهای دیگر قرار گرفتند. این نخستین گزارش از وجود PFBV از ایران می باشد.