شناسایی بیوانفورماتیکی ژن NKAIN1 به عنوان یک بیومارکر بالقوه مرتبط با سرطان پستان و بررسی بیان آن با استفاده از تکنیک Real Time PCR

سرطان پستان شایع ترین سرطان تشخیص داده شده و دومین علت مرگ و میر ناشی از سرطان ها در زنان در سراسر جهان است. در سال های اخیر، شناسایی بیومارکرهای بالقوه مرتبط با سرطان پستان و ترکیبات درمانی جدید منجر به پیشرفت های امیدوار کننده ای در درمان سرطان پستان شده است. هدف از مطالعه حاضر شناسایی بیومارکرهای بالقوه ی مرتبط با سرطان پستان است که با استفاده از دیتابیس ها و آنالیزهای بیوانفورماتیکی انجام می شود.

در این مطالعه از یک روش In silico برای شناسایی بیومارکرهای مرتبط با سرطان پستان بر اساس داده های ترانسکریپتوم استفاده شد. سپس از روش کمی  Real Time PCR (qRT-PCR) برای تجزیه و تحلیل بیان متفاوت بیومارکر شناسایی شده استفاده شد.

تجزیه و تحلیل با پایگاه های اطلاعاتی موجود مرتبط با سرطان، ارتباط بین افزایش بیان ژن NKAIN1 و سرطان پستان را نشان داد و تکنیک qRT-PCR افزایش سطح بیان این ژن را در بافت های سرطان پستان در مقایسه با بافت های طبیعی تایید نمود.

با توجه به نتایج آنالیز In silico و کمی سازی با RT-PCR، ژن NKAIN1 می تواند به عنوان یک نشانگر زیستی بالقوه در تشخیص سرطان پستان در سطح mRNA استفاده شود.