ردیابی و تعیین خصوصیات بیولوژیکی و فیلوژنتیکی ویروس Y سیب زمینی (PVY) جدایه استان لرستان

بیماری های ویروسی از جمله عوامل محدودکننده تولید سیب زمینی در جهان هستند. ویروس Y سیب زمینی (PVY) گونه جنس Potyvirus از خانواده Potyviridae یکی از مهم ترین بیماری های محصول سیب زمینی می باشد. به منظور ردیابی ویروس، تعداد 135 نمونه از گیاهانی که علایم موزاییک، کوتولگی، موجی بودن حاشیه برگ، لکه های کلروتیک و تغییر شکل برگ را نشان می دادند، از مزارع سیب زمینی استان لرستان جمع آوری گردید. عصاره گیاهان مشکوک در مرحله چهار برگی روی گیاهان محکNicotiana glutinosa ، N. occidentalis وN. debneyi مایه زنی گردید. پس از حدود ده روز علایمی نظیر زردی موضعی، رگبرگ روشنی و موزاییک روی N. occidentalis و پیسه ای شدن و نکروز موضعی روی N. glutinosa مشاهده شد. از گیاهان محک دارای علایم، استخراجRNA کل صورت گرفت و با استفاده از آزمون RT-PCR و آغازگرهای اختصاصی مربوط به بخشی از ناحیه ژنومی ژن CP و NIb ویروسPVY ، باندی در محدوده bp 1115 تکثیر شد و آلودگی نمونه ها به ویروس PVY اثبات شد. بررسی های فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه ایرانی مورد مطالعه دارای 48/99-74/98 درصد همسانی ژنتیکی با دیگر توالی های ثبت شده در این ناحیه درNCBI بود. نتایج تجزیه و تحلیل های ژنتیکی نشان داد که جدایه های ویروس PVY در دو گروه قرار گرفتند و جدایه ردیابی شده از استان لرستان در گروه II و در کنار جدایه های مربوط به کشور آلمان که متعلق به نژاد Wilga بودند، قرار گرفت. توالی نوکلیوتیدی قطعه مورد نظر در NCBI به شماره دسترسی MT655949 ثبت گردید. این اولین گزارش از آلودگی مزارع سیب زمینی استان لرستان به ویروسPVY به کمک آزمایشات مولکولی می باشد.