بررسی بیوانفورماتیک اختصاصیت miR-222-3p در اتصال به ژن های درگیر در لوسمی لنفوبلاستیک حاد در کودکان

 لوسمی لنفوسیتی حاد (Acute lymphocytic leukemia) ALL، نوعی سرطان است که بر روی سلول های سفید خون تاثیر می گذارد. این بیماری به سرعت پیشرفت می کند و نیاز به درمان فوری دارد. لوسمی لنفوبلاستیک حاد، شایع ترین نوع لوسمی است که کودکان را تحت تاثیر قرار می دهد. در خلال این بیماری افزایش مولکول miR-222-3p مشاهده شده است. از روش ریزآرایه می توان برای بررسی اتصالات این miRNA و ژن های هدف استفاده کرد، که این مورد با محدودیت هایی روبه رو است. بر همین اساس، در این مطالعه، از روش های کامپیوتری و بیوانفورماتیکی توسط نرم افزارهای مختلف و اختصاصی استفاده شد.

ژن های هدف با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های Mirbase، TargetScan، NCBI و RNAhybrid مشخص شدند و بر اساس امتیازات به دست آمده، اهداف دارای بالاترین تمایل شناسایی شدند.

یافته های این مطالعه نشان داد که ژن های CDH4، AJAP1، HNRNPA0، UBN1 و ZNF618 به عنوان اهداف بالقوه با اختصاصیت بالاتری برای miR-222-3p می باشند.

دو عامل میزان انرژی آزاد منفی و تعداد جفت بازهای تشکیل شده بین miRNA و UTR-3’ ژن های مختلف در انتخاب اهداف با اختصاصیت و تمایل بالاتر نقش دارند.