طراحی پروتئین کایمریک LAMP-BDNF با روش in Silico و تایید بیان این پروتئین در سطح اگزوزوم ها به منظور دارو رسانی از طریق سد خونی- مغزی

شکل بالغ فاکتور نوروتروفیک مشتق شده از مغز (BDNF)،  به گیرنده فاکتورهای رشد BDNF / NT-3 (Trk-B)متصل می شود. این اتصال منجر به فعال شدن مسیر پیام رسانی Ras-MAPK می شود که در رشد و تکثیر سلول ها دخیل است. کمبود BDNF با بروز بیماری های مختلف و ظهور اثرات پیری مرتبط می باشد. در این مطالعه هدف ما طراحی پروتیین کایمریک LAMP-BDNF و ارزیابی آن برای هدف قرار دادن سلول های عصبی توسط روش های in silico است.. به همین منظور، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، ساختار پروتیین کایمریک BDNF / LAMP2 پیش بینی و کیفیت آن تایید شد. سپس تعامل بین ساختارهای پروتیین BDNF / LAMP2 و Trk-B با استفاده از روش های داکینگ پروتیین-پروتیین مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. برای مقایسه فعل و انفعالات بین این دو پروتیین با فعل و انفعلات Trk-B با آنتی بادی خاص آن از روش برهم نهی ساختار استفاده شد. نتایج به دست آمده نشان داد که پروتیین کایمریک BDNF / LAMP2 می تواند ساختار اصلی مولکول BDNF را حفظ کند و می تواند به Trk-B نیز اتصال یابد. فعل و انفعالات بین پروتیین های  BDNF / LAMP2 و Trk-B مشابه فعل و انفعالات بین Trk-B و آنتی بادی اختصاصی آن بود. با توجه به این نتایج ، پروتیین کایمریک BDNF / LAMP2b که بر سطح  اگزوزوم ها بیان می شود، قادر است سلول های عصبی را هدف قرار دهد و سبب انتقال بهتر دارو به بافت مغز شود.