مطالعه کمی فعالیت- ساختار، داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی تعدادی از ترکیبات هتروسیکل شامل نیتروژن اکسید به عنوان عامل های ضد سل جدید
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (بدون رتبه معتبر)
چکیده:
هدف
عامل سل، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس است. یک سری از ترکیبات جدید هتروسیکل شامل نیتروژن اکسید، به عنوان بازدارنده های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس گزارش شده اند. در این راستا، هدف پژوهش حاضر مطالعه QSAR، داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی تعدادی از ترکیبات هتروسیکل شامل نیتروژن اکسید به عنوان عامل های ضد سل جدید است.مواد و روش ها
الگوریتم رقابت استعماری، PLS، PCR، LASSO و شبیه سازی مونته کارلو در محاسبات QSAR انجام گردید. همچنین محاسبات داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی میتوباکتریوم توبرکلوزیس با کد 4XGQ انجام شده است.یافته ها
جرم های اتمی، الکترونگانیویتی اتمی ساندرسون، شاخص Ghose-Viswanadhan-Wendoloski hyptonic-like و شاخص Ghose-Viswanadhan-Wendoloski antiinfective-like در این بررسی مهم بودند. در برنامه کورال سی، از فایل اسمایل استفاده شد. RMSE برای آموزش و تست در الگوریتم رقابت استعماری، به ترتیب 1395/0 و 2970/0 بودند. در روش مونته کارلو نتایج برای سری آموزش به صورت 7n=، 9931/0R²=، 9857/0 Q²= و 039/0 MAE=و برای سری تست به صورت 6n=، 9413/0R²=، 9107/0Q²= و 367/0 MAE=بدست آمد.نتیجه گیری
مولکول های 10 و 11 ترکیبات پایداری هستند که برای بررسی های بیشتر از جمله مطالعات آزمایشگاهی کلینیکی پیشنهاد می شوند.کلیدواژگان:
QSAR ، داکینگ ، شبیه سازی دینامیک مولکولی ، هتروسیکل ، نیتروژن اکسید ، سل
زبان:
فارسی
صفحات:
23 تا 40
لینک کوتاه:
magiran.com/p2595025
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!