ارزیابی بیوانفورماتیک و سیگنالی مجموع mRNA هدف و عملکرد SNP مرتبط با آن در افراد مبتلا به سرطان معده

سرطان معده در جهان به عنوان چهارمین سرطان شایع و دومین عامل مرگ بر اثر سرطان شناخته می شود. که علاوه بر هزینه های قابل توجه، مشکلات عدیده ای را بر خانواده ها تحمیل نموده که خود توجیه مناسبی جهت شناسایی بیومارکرهای مرتبط می باشد.

برای یافتن اطلاعات بیوانفورماتیکی از وبسایت miRBASE  استفاده شد. همچنین پایگاه های داده  mirWALK و miRNASN برای یافتن اطلاعات مربوط به miRNA ها جستجو شدند . برای یافتن مسیر سرطانی از پایگاه های داده DAVID database و Kegg استفاده شد.

مطالعات انجام شده در اولین مسیر، میکرو RNA، has-miR-10a-3p، با اتصال به rs1049216 در ژن CASP3،  با اعمال اثر مهاری بر این ژن، از ایجاد سرطان جلوگیری می نماید. در دومین مسیر، میکرو RNA، has-miR-296-3p، با اتصال به rs1564483 در ژن BCL2، با اعمال اثر مهاری بر این ژن، باعث ایجاد سرطان می شود. در سومین مسیر، میکرو RNA، has-miR-194-3p، با اتصال به rs7177 در ژن CCND1، با اعمال اثر مهاری بر این ژن، از ایجاد سرطان جلوگیری می نماید.

در این پژوهش مسیرهای سرطانی ای پیش بینی شد که دخیل در سرطان معده هستند،  با یافتن سه SNP بر روی مناطق خاصی از این سه ژن، دریافتیم که این SNPها می توانند عامل ایجاد سرطان معده باشند و می توانند به عنوان بیومارکرهای زیستی معرفی و به کار روند.