مکان یابی یک ژن ABC-Transporter مرتبط با بیماری اسکالد جو (Rhynchosporium secalis (Oud.) Davis) با استفاده از یک نشانگر CAPS

خانواده بزرگ پروتئین های ABC-Transporter به عنوان یک پل ارتباطی در غشاهای سلولی همه موجودات زنده یافت می شوند. این پروتئین ها مسئول تبادل مواد گوناگون از جمله متابولیت های دخیل در مکانیسم های دفاعی گیاهان می باشند. در این تحقیق، جهت مکان یابی یک ژن ABC-Transporter اختصاصی در برهمکنش سازگار و ناسازگار با قارچ R. secalis عامل بیماری اسکالد جو از SNP ها و نشانگر CAPS استفاده شد. یک قطعه kb2/2 حاصل از فراورده PCR با آغازگر های اختصاصی برای ژن مذکور در 10 والد جو توالی یابی شد و پس از همردیفی برای کشف SNPها مورد استفاده قرار گرفت. در میان SNPهای مشاهده شده، یک SNP با تفاوت در جایگاه برشی آنزیم NlaIII در والدین Chebec و Harrington مشاهده و برای تبدیل به نشانگر CAPS و مکان یابی استفاده شد. نتایج مکان یابی موقعیت این ژن را روی بازوی بزرگ کروموزوم شماره 3 جو تعیین کرد. همچنین نتیجه بررسی همولوژی در این ناحیه از کروموزوم نیز همچون مطالعات قبلی نشاندهنده وجود Synteny بالا برای کروموزوم شماره 3 جو با کروموزوم شماره 1 برنج بود.