جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری(RGAs) در سیب زمینی با استفاده از روش

استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان یابی ژن های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در سیب زمینی از روش Motif directed Profiling (MdP) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت شده TIR ژن های مقاومت به بیماری گیاهی برای تکثیر آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در 46 نتاج F1 حاصل از تلاقی دو والد دیپلویید هتروزیگوت SH83-92-488(SH) و RH89-039-16(RH) با حداکثر نوترکیبی مورداستفاده قرار گرفت. در مجموع 454 نشانگر چندشکل حاصل شد که با استفاده از نقشه پیوستگی AFLP جمعیت متشکل از 10000 نشانگر، مکان یابی شدند. برای شناسایی RGAها تعدادی از نوارها جداسازی و توالی یابی شدند که 11/66 درصد آن ها (160 نوار) تشابه معنی دار با ژن های مقاومت شناخته شده و RGAها داشتند و اغلب این RGAها در نواحی ژنومی سیب زمینی و گوجه فرنگی دارای خوشه های RGA مکان یابی شدند. نقشه پیوستگی این RGAها در ارتباط با نقشه پیوستگی فوق اشباع این جمعیت با 10000 نشانگر AFLP نشان داد که اغلب این RGAها در خوشه ها یا زیرخوشه های جدید یا موجود در نقشه گروه بندی شدند. تعداد 117 نشانگر در مکان های منطبق با خوشه های ژن های مقاومت روی کروموزوم های 5، 6، 9 و 11 و همچنین 15 نشانگر در جایگاه تقریبی مکان های ژنی کمی مقاومت موجود در کروموزوم های 1، 2، 4 و 7 مکان یابی شدند. اکثریت این RGAها، معرف توالی های RGA جدید بودند. نتایج حاصل از این پژوهش می تواند در مکان یابی ژن های مقاومت منفرد و مکان های کمی مقاومت به بیماری ها مورداستفاده قرار گیرد.