فهرست مطالب

دانش زیستی ایران - سال چهاردهم شماره 1 (بهار 1398)

نشریه دانش زیستی ایران
سال چهاردهم شماره 1 (بهار 1398)

  • تاریخ انتشار: 1398/03/01
  • تعداد عناوین: 6
|
  • لیلا سلگی، صدیقه فراهانی، شهره زارع کاریزی* صفحات 1-7
    زمینه و هدف

    FOXP3 برای تولید و عملکرد سلول‏های تنظیمی T (Treg) مورد نیاز است. این ژن در تنظیم پاسخ های التهابی و نمو سلول‏های عصبی دخیل است. میگرن یک بیماری التهابی، با توارث چند عاملی می‏باشد. به نظر می‏رسد که ژن‏های متعددی در بروز این بیماری دخیل هستند. هدف از مطالعه حاضر بررسی رابطه چندشکلی‏ rs3761548 در ژن foxp3 با استعداد ابتلا به بیماری میگرن است.

    مواد و روش‏ها

    در این مطالعه 148 بیمار مبتلا به میگرن و 149 فرد سالم به عنوان کنترل شرکت کردند. پس از استخراج DNA، تعیین ژنوتیپ با استفاده از روش PCR-RFLP انجام شد. آزمون مربع کای به منظور بررسی تفاوت بین فراوانی آللی و ژنوتیپی افراد بیمار و کنترل با استفاده از نرم افزار SPPS ver16 و میزان خطر نسبی افراد با میگرن با استفاده از آزمون رگرسیون لجستیک بررسی گردید.

    یافته‏ ها

    تفاوت معناداری بین توزیع آللی و ژنوتیپی چندشکلی rs3761548 foxp3 در زنان و مردان مبتلا به میگرن نسبت به گروه کنترل وجود ندارد (p=0.08).

    نتیجه گیری

    این مطالعه، اولین گزارش مربوط به ارتباط چندشکلی ژن foxp3 با استعداد ابتلا به میگرن است. مطالعه بیشتر مسیرهای مرتبط با FOXP3 و شبکه ‏های ژنی ممکن است منجر به درک بهتر پاتوفیزیولوژی میگرن و علایم مرتبط با آن شود.

    کلیدواژگان: میگرن، چندشکلی، rs3761548، ژن FOXP3، سلول های تنظیمی T
  • سحر هنرمند جهرمی*، فهیمه باغبانی آرانی، فاطمه یعقوبی صفحات 9-18

    استفاده از پروبیوتیک هایی مانند باکتری های اسید لاکتیک (LAB) برای تولید مواد غذایی ارزشمند یک روند پذیرفته شده جهانی است. محصولات لبنی ساخته شده از شیر خام تولید شده محلی با ویژگی های ذاتی مختلف آنها بخش مهمی از رژیم روزانه را تشکیل می دهند. این امر لبنیات را منبع غنی برای غربالگری LAB می کند. هدف از مطالعه جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری های اسید لاکتیک با ویژگی پروبیوتیک از ماست های سنتی شهرستان ورامین است. تعداد 32 نمونه ماست سنتی از شهرستان ورامین جمع آوری شدند و باکتری های اسید لاکتیک بر اساس تست های بیوشیمیایی جداسازی و شناسایی شدند. ویژگی پروبیوتیکی باکتری ها بر اساس تست تحمل اسید و تحمل املاح صفروای تعیین شد. پس از شناسایی مولکولی با روش PCR و تعیین توالی تعدادی از نمونه ها ، باکتری های جداسازی شده در سطح جنس و گونه شناسایی شدند. تعداد 9 عدد باکتری اسیدلاکتیک جداسازی و شناسایی شدند. 7 جدایه باکتری اسید لاکتیک از نمونه ماست های گاوی و 2 جدایه از ماست های گوسفندی جداسازی شد.خصوصیات مورفولوژی و بیوشیمیایی و توانایی تخمیر قندها توسط باکتریهای اسید لاکتیک جداسازی شده بررسی شد. از نظر تست تحمل اسید 8 سویه مقاوم به اسید گزارش شدند و همه 9 سویه نست به املاح صفراوی مقاومت نشان دادند. همه 9 ایزوله جداسازی شده حاوی ژن 16srRNA بودند. نتایج تعیین توالی سه ایزوله باکتریایی، وجود یک باکتری Lactobacillus casei و دو باکتری Enterococcus faecium را نشان داد. باکتری های اسیدلاکتیک جدا شده در این مطالعه دارای خواص پروبیوتیک بودند.

    کلیدواژگان: باکتری های اسید لاکتیک، ماست، پروبیوتیک، ورامین
  • معصومه حسن بارانی*، فریبا شریف نیا، مصطفی اسدی صفحات 19-34

    تباره Delphinieae در زیر تیره Ranunculoideae تقریبا دارای 700 گونه است. Delphinium یکی از جنس های تباره Delphinieae است که در ایران دارای دو زیر جنس می باشد. اختلاف زیر جنس ها در دوره رویشی و شکل دانه می باشد. در زیر جنس Olighophyllon گیاهان دروه رویشی چندساله و در زیر جنس Delphinium گیاهان یکساله هستند. در این مطالعه، دانه گرده 27 گونه از جنس Delphinim مورد بررسی میکروسکوپ الکترونی نگاره قرار گرفت. شکل کلی دانه های گرده به سه گروه کروی، بیضوی و تقریبا بیضوی گروه بندی شد و تزیینات سطح دانه گرده در این جنس به صورت میکرواکینت، میکرواکینت- سوراخ دار و مشبک مشاهده گردید. آنالیز تجزیه خوشه ای با نرم افزار SPSS انجام شد. همچنین آنالیز PCA انجام گرفت و متغیر ترین صفات مشخص شدند . نتایج نشان داد مولفه اول شامل صفات نسبت P/E، اندازه طول محور قطبی و اندازه طول شیار و مولفه دوم شامل صفات اندازه قطر محور استوایی و اندازه مزوکولپیوم می باشند که بیشترین نقش را در بررسی شباهتها و تفاوت های تاکسون ها داشته اند. مطالعات دانه گرده جنس Delphinium در این پژوهش نشان می دهد که گونه های نزدیک به هم از نظر ریخت شناسی، دارای صفات گرده شناسی کاملا مشابه نمی باشند، در حقیقت مطالعات گرده شناسی قادر به گروه بندی و تیپ بندی گونه های مورد مطالعه نیست. فنوگرام گرده شناسی این تحقیق اطلاعات مفیدی برای مشخص کردن جایگاه و وضعیت گونه های D. elbursense، D. saniculifolium، D. aquilegifolium و برخی از گونه های دیگر فراهم می کند.

    کلیدواژگان: Delphinium، میکروسکوپ الکترونی، تجزیه خوشه ای، آنالیز PCA
  • مجید عبدلی* صفحات 35-53

    به منظور بررسی تاثیر تاریخ کاشت بر شاخصهای فیزیولوژیکی رشد ذرت، آزمایشی به صورت بلوکهای کامل تصادفی با سه تکرار در ورامین در سال 1394 اجرا شد. تیمارها شامل پنج تاریخ کاشت (20 فروردین، 31 اردیبهشت، 28 خرداد، 9 تیر و 24 تیر ماه) و رقم مورد استفاده سینگل کراس کارون 701 بود. در هر یک دوره های 5 الی 7 روزه از هر کرت، 5 بوته به صورت تصادفی انتخاب و صفات مورد بررسی در ارتباط با این تحقیق شامل: وزن خشک کل، سطح برگ و وزن خشک برگ جهت رسم منحنی شاخصهای رشدی و فیزیولوژیکی گیاه ذرت طی فصل رشد اندازه گیری شدند. نتایج نشان داد که اثر تاریخ کاشت بر حداکثر وزن خشک برگ، وزن خشک کل، شاخص سطح برگ، سرعت رشد نسبی، سرعت رشد محصول، سطح ویژه برگ و عملکرد تر معنیدار بود. در این بین، تاریخ کاشت چهارم (9 تیر ماه) بیشترین میزان حداکثر وزن خشک برگ، وزن خشک کل، شاخص سطح برگ، سرعت رشد محصول و عملکرد تر را به خود اختصاص داد و تاریخ کاشت دوم (31 اردیبهشت ماه) از نظر حداکثر سرعت رشد نسبی و سطح ویژه برگ نسبت به بقیه تاریخ های کاشت برتری داشت. سرعت رشد محصول پس از رسیدن به حداکثر میزان خود در تاریخ های مختلف کاشت تنزل یافته و در نهایت منفی شد. با توجه به نتایج این تحقیق میتوان کاشت ذرت در دهه اول تیرماه را برای منطقه ورامین توصیه کرد.

    کلیدواژگان: ذرت، شاخص های فیزیولوژیکی رشد، تاریخ کاشت، ورامین، عملکرد
  • فاطمه نوربخش*، مژگان علیکاهی، معصومه مهدوی صفحات 55-63
    مقدمه

    در حال حاضر بسیاری از داروهای ارزشمند اثر خود را بر اسینتوباکتر بومانی از دست داده اند و مقاومت دارویی اسینتوباکتربومانی علت اصلی شکست درمان عفونتهای بیمارستانی ناشی ازآن میباشد. هدف از این تحقیق بررسی اثر اسانس آویشن و نانو ذره اکسید روی بر اسینتوباکتر بومانی دارای مقاومت چند دارویی میباشد.

    مواد و روش ها

    این مطالعه بر روی46 سویه اسینتوباکتر بومانی جدا شده از نمونه های بالینی بیماران بیمارستان قلب تهران انجام گرفت. حساسیت آنتی بیوتیکی باکتری های جداشده با روش انتشار از دیسک بر اساس استاندارد 2018 CLSI تعیین شد. آزمون میکرودایلوشن براث برای تعیین حداقل غلظت بازدارندگی (MIC) برای آنتی بیوتیک های آمیکاسین، سیپروفلوکساسین، ایمیپنم، اسانس آویشن و نانو ذره اکسید روی انجام شد.

    یافته ها

    براساس نتایج به دست آمده از تست های تعیین حساسیت به روش دیسک دیفیوژن مشخص شد که بیشترین میزان مقاومت سویه ها به آنتی بیوتیک های ایمیپنم و سیپروفلوکساسین به میزان 82/97% بوده است. در مطالعه حاضر بیشترین حساسیت سویه ها به اسانس آویشن در غلظت µg/ml 5/0 و کمترین حساسیت متعلق به غلظت های 312/0 و 625/0 µg/ml مشاهده شد، همچنین بر اساس نتایج به دست آمده در این مطالعه بیشترین حساسیت سویه ها به نانو ذره در غلظت µg/ml 4096و کمترین حساسیت در غلظت µg/ml 256 بوده است.

    بحث و نتیجه گیری

    نتایج این پژوهش بیانگر اثر مهار کنندگی قوی اسانس آویشن و نانو ذره اکسید روی براسینتوباکتربومانی دارای مقاومت چند دارویی می باشد .

    کلیدواژگان: اسینتوباکتر بومانی، اسانس آویشن، نانو ذره اکسید روی
  • معصومه مهدوی* صفحات 67-76

    اسانس های گیاهی دارای اثرات ضدمیکروبی و فارماکولوژیکی متعددی هستند، اما بسیار فرار می باشند. کپسوله شدن مواد دارویی در نانو ذرات پلیمری می تواند اثرات درمانی ترکیباتی که عموما فرار هستند را بهبود دهد. کیتوسان به عنوان بیوپلیمر زیست تخریب پذیر به دلیل کپسوله کردن بهتر، رهاسازی کنترل شده و سمیت پایین در انتقال دارو بسیار مورد توجه می باشد. هدف از این مطالعه، بررسی فعالیت ضد باکتریایی اسانس آویشن شیرازی کپسوله شده در نانوژل های کیتوسان- اسید کافییک در مقایسه با اسانس آزاد می باشد. ابتدا نانوژل، به روش خود تجمعی از پلیمر کیتوزان و اسید کافییک سنتز شد و پس از بررسی شکل و اندازه آنها با روش های اسپکترومتری (FTIR)، میکروسکوپی الکترونی نگاره (SEM) ، از آن به منظور کپسوله کردن اسانس آویشن شیرازی استفاده شده است. سپس اثر ضدباکتریایی اسانس کپسوله شده و اسانس آزاد با روش دیسک دیفیوژن و میکرودایلوشن براث بررسی شد. نتایج نشان داد که اسانس کپسوله شده در مقایسه با اسانس آزاد، اثر ضد باکتریایی بیشتری بر علیه باکتری های مطالعه شده دارد.

    کلیدواژگان: اسانس آویشن شیرازی، کیتوسان، کپسوله شده، اثر ضد میکروبی
|
  • Leila Solgi, Sedigheh Farahani Pages 1-7
    Background

    FOXP3 is required for the generation and function of regulatory T (Treg) cells. The gene is involved in regulation of inflammatory responses and neuronal cell development. Migraine is an inflammatory disease and is considered as a polygenic multifactorial disease, and it seems that many genes are involved in this disease. The aim of the present study is to determine if any relation exists between foxp3 rs3761548 gene polymorphisms on the individual susceptibility of migraine.

    Materials and methods

    In this study, 148 patients with clinically definite migraine and 149 ethnically-matched healthy controls participated. Genotyping was performed using PCR-RFLP method for the mentioned polymorphisms in the FOXP3 gene. Logistic regression test were used for estimating odd ration and 95% CI by using SPSS ver.16 software.

    Results

    No significant difference in distribution of foxp3 rs3761548 alleles and genotypes was found in females and males with a history of migraine in comparison to control (p=0.08).

    Conclusion

    This is the first report concerning the association between foxp3 gene polymorphisms and migraine. The further study of FOXP3 related pathways and gene networks might result in the better understanding of the pathophysiology of migraine and related symptoms.

    Keywords: migraine_polymorphisms_rs3761548_FOXP3 gene_regulatory T cells
  • Fahimeh Baghbani Arani, Fatemeh Yaghoubi Pages 9-18

    Using probiotics such as Lactic Acid Bacteria (LAB) to produce valuable food is a universally accepted trend. Dairy products made from locally produced raw milk with different inherent characteristics make up an important part of the daily diet. This makes dairy a rich source of LAB screening. The aim of study was to isolate and identify probiotic lactic acid bacteria from traditional yogurt in Varamin province. 32 samples of traditional yogurt were collected from Varamin and lactic acid bacteria were isolated and identified based on biochemical tests. The probiotic properties of the bacteria were determined based on acid tolerance test and bile salt stability test. After molecular identification by PCR and sequencing of some samples the isolated bacteria were identified at the genus and species level. Nine lactic acid bacteria were isolated and identified. Seven lactic acid bacterial isolates were isolated from bovine yogurt samples and 2 isolates from sheep yogurts. Morphological and biochemical properties and fermentation ability of sugars were investigated by isolated lactic acid bacteria. In acid tolerance test, 8 acid-resistant strains were reported and all 9 non-acid-resistant strains were resistant to bile salts. All 9 isolates contained 16srRNA gene. The results of sequencing three isolates showed the presence of one Lactobacillus casei and two Enterococcus faecium. Most of the lactic acid bacteria isolated in this study had probiotic properties.

    Keywords: Lactic acid bacteria, Yogurt, Probiotic. Varamin
  • Masoomeh Hasanbarani *, Fariba Sharifnia, Mostafa Assadi Pages 19-34

    Delphinieae tribe in Ranunculoideae subfamily has about 700 species. Delphinium is one of the genus in Delphinieae that has 29 species and two subgenus in Iran. Differences between subgenera are in the form of seed and vegetative period. Olighophyllon and Delphinium, which are perennial and annual species, respectively. In this study pollen grains of 27 species were examined by Scaning Electron Microscope. Pollen grains were grouped into spheroidal, prolate-spheroidal and subprolate-perprolate. In this genus surface ornaments of grain were seen as scabrate ،microperforate scabrate- and scabrate-reticulate. To investigate similarities among genus for palynology characteristics, cluster analysis was performed by SPSS. Also, PCA analysis was performed and the most variable characteristics were determined. The results showed that the first component included P / E ratio traits, polar axis length and colpi length size, and the second component included equatorial axis diameter and mesocolpium size traits, which played the most important role in the similarities and differences of taxons. Micro-morphological studies of Delphinium pollen in this study show that closely related species do not have very similar morphological characters. Pollen characters could not group the species studied. Pollen Phenogram in this study provides useful information to determine the status of D. elbursense, D. saniculifolium, D. aquilegifolium, and many other species.

    Keywords: Delphinium, Scaning Electron Microscope, Cluster analysis, PCA analysis
  • Majid Abdoli * Pages 35-53

    In order to investigate the effect of sowing date on the physiological growth indices of maize, an experiment was performed in the form of randomized complete blocks with three replications in Varamin at 2015 year. The treatments included five sowing dates (9th of April, 21th of May, 18th of June, 30th of June and 15th of July) and the cultivar of Karoun (single cross 701) used. In each of the 5 to 7 day periods of each plot, 5 plants were randomly selected and the traits studied in connection with this study included: total dry weight, leaf area and leaf dry weight to draw the curve of physiological growth indices of maize plants during the growing season. The results showed that the effect of sowing date was significant on the maximum leaf dry weight, total dry weight, leaf area index (LAI), relative growth rate (RGR), crop growth rate (CGR), specific leaf area (SLA) and fresh yield. In the meantime, the fourth sowing date (30th of June) had the highest maximum leaf dry weight, total dry weight, leaf area index, CGR and fresh yield, and the second sowing date (21th of May) was superior to the rest of the sowing dates in terms of maximum RGR and SLA. The CGR was reduced in different sowing dates after reaching its maximum and eventually became negative. According to the results of this study, maize sowing in the first decade of July can be recommended for Varamin region.

    Keywords: Maize, Physiological growth indices, Sowing date, Varamin, Yield
  • Fatemeh Noorbakhsh *, Mozhgan Alikahi, Maasuomeh Mahdavi Ourtakand Pages 55-63
    Introduction

    Many valuable drugs have now lost their effect on Acinetobacter baumannii, and the drug resistance of A. baumannii is a major cause of failure in the treatment of hospital infections. The aim of this study was to investigate the effect of Thymus vulgaris essential oil and ZnO nanoparticles on multidrug resistant Acinetobacter baumannii.

    Materials and Methods

    This study was performed on 46 strains of A. baumannii isolated from clinical samples of patients at Tehran Heart Hospital. Antibiotic susceptibility of the isolates was determined by disk diffusion method according to CLSI 2018 standard. Micro-dilution broth test was then performed to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) for amikacin, ciprofloxacin , imipenem antibiotics, T. vulgaris essential oil and ZnO nanoparticles.

    Results

    Based on the results of disk diffusion sensitivity tests, it was found that the highest resistance to imipenem and ciprofloxacin antibiotics were 97.82%. In the present study the most susceptible strains to the T. vulgaris essential oil were observed at concentration 0.5 µg/ml and the least sensitivity at concentrations 0.312 and 0.625 µg/ml. also based on the results obtained in this stady the highest susceptible strains to ZnO nanoparticles was at concentrations 4096 µg/ml and the lowest sensitivity at concentrations 256 µg/ml.

    Discussion & Conclusion

    the results of this study indicate the potent inhibitory effect of T. vulgaris essential oil and ZnO nanoparticles on Acinetobacter baumannii

    Keywords: Acinetobacter baumannii, Thymus vulgaris essential oil, ZnO nanoparticles
  • Maasuomeh Mahdavi Ourtakand * Pages 67-76

    Essential oils have many antimicrobial and pharmacological effects, but they are very volatile. The capsulation of drug substances in polymer nanoparticles can improve the therapeutic effects of compounds that are generally volatile. Chitosan is considered as biodegradable biopolymer due to better capsulation, controlled release, and low toxicity in drug delivery. The aim of this study was to investigate the antibacterial activity of Zataria multiflora essential oil capsulated to chitosan- caffeic acid nanogels in comparison to free essential oils. First, nanogel was synthesized by self-cumulative polymerization of chitosan and caffeic acid, and their shape and size were analyzed by spectrophotometric (FTIR) and scanning electron microscopy (SEM), then nanogel was Used for capsulation of Z. multiflora essential oil. Antimicrobial effect of capsulated and free essential oil was studied by disc diffusion and broth microdilution method. The results showed that the capsulated essential oil had a higher bactericidal effect on the bacteria than free essential oil.

    Keywords: Zataria multiflora essential oil, Chitosan, Capsulated, antimicrobial effect