فهرست مطالب

نشریه دانش زیستی ایران
سال چهاردهم شماره 4 (زمستان 1398)

  • تاریخ انتشار: 1398/12/25
  • تعداد عناوین: 6
|
  • شناسایی سویه های باکتریایی مقاوم به کروم از فاضلاب پالایشگاه نفت کرمانشاه با استفاده از توالی یابی واکنش زنجیره ی پلیمراز 16S rDNA و بررسی رشد باکتری های مقاوم در غلظت-های مختلف کروم
    سپیده خدامرادی*، رامین عبیری صفحات 1-10
    هدف از مطالعه حاضر بررسی شناسایی سویه های مقاوم باکتریایی جدا شده از فاضلاب پالایشگاه نفت کرمانشاه با استفاده از توالی یابی واکنش زنجیره ی پلیمراز 16S rDNA از جهت شناسایی بهترین سویه با بزرگترین میزان حذف کروم از طریق زیست پالایی و بررسی رشد باکتری های مقاوم در غلظت های مختلف کروم بود. در این مطالعه 94 نمونه از فاضلاب پالایشگاه جمع آوری شد. باکتری ها با استفاده از مورفولوژی، رنگ آمیزی گرم، تست های بیوشیمیایی و آزمون های میکروبیولوژی استاندارد تشخیص داده شدند، جداسازی شدند و با کروم شش ظرفیتی در غلظت های 25، 50، 100 و 150 میلی گرم/میلی لیتر برای 96 ساعت در یک شیکر اوربیتال انکوبه شدند. بزرگترین پالایش زیستی (35/0 میلیون در قسمت) در دمای 28 درجه ی سانتیگراد و pH در محدوده ی 00/8-50/7 مشاهده شد. نیاز زیستی اکسیژن در محدوده ی 126 تا 530 بود. بیشترین ایزوله ها دارای نیاز شیمیایی اکسیژن در محدوده ی 20/7 تا 90/7 بودند. بیشتر ایزوله ها (30/53%) دارای نیاز اکسیژنی بین 80/7 تا 90/7 بودند. بر اساس نتایج این مطالعه، سویه های Klebsiella variicola, Bacillus aerius، Lysinibacillus fusiformis وBacillus stratosphericus گونه های مقاومی بودند. رشد باکتری های به ترتیب در تیمارهای کنترل، 25، 50، 100 و 150 میلی گرم بزرگتر بود. تمام باکتری ها از 72 ساعت به بعد روال ثابتی از رشد را نشان دادند. با در نظر گرفتن مقاومت زیاد سویه های Klebsiella variicola, Bacillus aerius, Bacillus stratosphericus وLysinibacillus fusiformis این سویه ها می توانند برای زیست پالایی کروم و کاهش آلودگی ها در محیط های آلوده به کروم، خصوصا پالایشگاه های نفت استفاده شوند.
    کلیدواژگان: کروم، زیست پالایی، پالایشگاه نفت، کرمانشاه، نیاز زیستی اکسیژن
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
  • بررسی اثر دیکلازوریل بر عملکرد رشد در جوجه های گوشتی آلوده به آیمریا تنلا
    حامد زارعی*، مصطفی شاه حسینی صفحات 11-16
    کوکسیدیوز مهمترین بیماری انگلی تک یاخته ای صنعت پرورش طیور گوشتی می باشد و مبارزه با بیماری کوکسیدیوز از مسایل مهم دامپروری و دامپزشکی است. خسارت های ناشی از کوکسیدیوز در گله های طیور بالغ بر یک میلیارد دلار در سال می-باشد. دیکلازوریل جزی دسته دارویی بنزیل استونیتریل محسوب می شود که در عفونت های کوکسیدیایی طیور به کار می رود بر این اساس تعداد 90 قطعه جوجه گوشتی یک روزه در3 گروه به شرح زیر پرورش یافت. گروه 1: دریافت کننده جیره پایه در کل دوره آزمایش.گروه 2: دریافت کننده جیره پایه + 25/0 میلی لیتر از سوسپانسیون حاوی 30000 عدد اووسیست آیمریا تنلا از چهارده روزگی (تلقیح دهانی). گروه3: دریافت کننده جیره پایه + 25/0 میلی لیتر از سوسپانسیون حاوی 30000 عدد اووسیست آیمریا تنلا از چهارده روزگی (تلقیح دهانی) + کوکسیدیواستات دیکلازوریل (به میزا ن 200 گرم در هر تن) از یک روزگی. در سن 28 و 49 روزگی از هر گروه 9 جوجه به طور تصادفی انتخاب و شاخص های عملکرد رشد مورد ارزیابی قرار گرفت. دیکلازوریل در گروه درمان موجب افزایش طول لوله گوارش گردید.
    کلیدواژگان: دیکلازوریل، کوکسیدیوز، عملکرد رشد، آیمریا تنلا، جوجه گوشتی
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
  • مطالعه ویروس های هرپس سیمپلکس 1 و 2 و سیتومگالوویروس در بیماران آلزایمری
    سپیده خدامرادی*، محمدحسن شاه حسینی، طاهر محمدیان، آتوسا فردوسی صفحات 17-22

    فاکتورهای محیطی مختلفی مثل عفونت ها باعث ایجاد بیماری آلزایمر می شوند. مطالعات نشان داده اند که ویروس های هرپس سیمپلکس 1 و 2 و سیتومگالوویروس با بیماری آلزایمر ارتباط دارند. سیتومگالوویروس انسانی باعث ایجاد عفونت در سیستم عصبی مرکزی می شود. مطالعه ای نیاز بود که به بررسی ویروس های مختلف در بیماران آلزایمری بپردازد. این مطالعه برای اولین بار به بررسی ویروس های مختلف در بیماران آلزایمری می پردازد. در این مطالعه 100 بیمار با آلزایمر مورد مطالعه قرار گرفتند و نمونه های خون (5/1 میلی لیتر هر نفر) گرفته شد. بعد از جداسازی DNA ویروسی، نمونه ها توسط روش PCR مورد بررسی قرار گرفت. داده های مربوط به افراد با نتایج مولکولی مثبت توسط نرم افزار SPSS نسخه ی 23 و تست Kruska-Walis تحلیل شدند. شیوع سیتومگالوویروس، HSV1, HSV2 به ترتیب در 27، 8 و 4 فرد مشاهده شد که برابر با 27%، 8% و 4% بود. این نتایج پیشنهاد می کنند که عفونت های سیتومگاویروس ها همبستگی با افزایش احتمال بیماری آلزایمرو نرخ سریع کاهش شناخت در جمعیت مسن دارد. در مجموع هر سه ویروس در بیماران شناسایی شدند، ولی فراوانی سیتومگالوویروس در بیماران بیشتر بود.

    کلیدواژگان: هرپس سیمپلکس، سیتومگالوویروس، آلزایمر، شیوع
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
  • شناسایی ماهی های منابع آبی جنوب شرق استان تهران (منطقه ورامین)
    سحر ستاروند، سیامک یوسفی سیاه کلرودی* صفحات 23-30
    در تحقیق حاضر شناسایی و بررسی تنوع گونه ای و فراوانی ماهیان منابع آبی جنوب شرق استان به مدت 6 ماه انجام گردید. برای این منظور 5 ایستگاه انتخاب و سپس ماهیان توسط وسایل صید مختلف مانند تور گوشگیر، تور دستی (ساچوک) و الکتروشوکر به طور ماهانه صید شده و به آزمایشگاه منتقل و توسط کلیدهای شناسایی معتبر شناسایی شدند. هدف از بررسی حاضر، شناسایی جنس، گونه های ماهیان، پراکنش زمانی و مکانی و فراوانی در این منطقه بود. نتایج این بررسی نشان داد که 3 خانواده از 6 جنس و 9 گونه مورد شناسایی قرار گرفت که از این تعداد 4 جنس و 6 گونه به خانواده کپور ماهیان تعلق داشت. پس از خانواده کپور ماهیان، خانواده ,Balitoridae با دارا بودن 2 گونه در جایگاه بعدی قرار گرفته است. آخرین خانواده در این تحقیق، خانواده کپور ماهیان دندان دار زنده زا (Poeciliidae) با یک جنس و یک گونه Gambusia holbrooki یافت شده است.
    کلیدواژگان: شرق استان تهران، گونه، ماهی، فراوانی، تنوع
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
  • بررسی همبستگی میان واریانت های دو ژن MLH3 (rs175080) TEX11 (rs6525433) در مردان ایرانی نابارور آزواسپرمی.
    هانیه سزاوار، زهرا نورمحمدی*، مسعود شیدایی صفحات 31-41

    ناباروری یکی از شایع ترین مشکلاتی است که حدودا بین 1 از 6 زوج در سراسر جهان به آن مبتلا هستند. یک وضعیت پیچیده بالینی ناشی از برهمکنش عوامل ژنتیکی و محیطی که علت آن در نیمی از موارد به مردان مربوط میشود. ژن MLH3 و TEX11 نقش کلیدی در مکانیسم ترمیم DNA و کراسینگ اور دارند. در این مطالعه به بررسی تنوع ژنتیکی و ارتباط یک واریانت تک نوکلیوتیدی (SNP) از ژنrs175080 ،MLH3 و همچنین یک واریانت دیگر rs6525433 مربوط به ژن TEX11 با مردان آزواسپرم ایرانی پرداخته شده است. روش کار نمونه ها از 120 مرد نابارور آزواسپرم و 115 فرد سالم به عنوان کنترل جمع آوری شده است. به منظور بررسی این دو واریانت از (tetra- Amplification Refractory Mutation System- PCR) TETRA-ARMS-PCR و PCR-RFLP و تعیین توالی استفاده شد. نتایج و بحث: فراوانی ژنوتیپ های GG و GA در ژن MLH3 بترتیب در مردان آزواسپرم 9/30% و 1/69% و در گروه کنترل بترتیب 3/31% و 7/68% (P=0.619) بود. واریانت rs6525433 در جامعه مطالعه شده فقط یک نفر کنترل ژنوتیپ C و مابقی ژنوتیپ T نشان دادند. نتایج نشان داد که واریانت rs175080 در ژن MLH3 و واریانت rs6525433 در ژن TEX11 با خطر آزواسپرمی مردان ارتباطی نداشت. نتایج دموگرافی بر روی نمونه های مورد مطالعه نشان داد در صفات قومیت، pH و مصرف سیگار تفاوت معناداری نداشت. نتایج این تحقق نشاندهنده عدم ارتباط مدلهای مختلف وراثتی ژنوتیپهای چند شکلی های واقع در ژنهای MLH3 و TEX11 در جامعه مورد مطالعه بود.

    کلیدواژگان: آزواسپرمی، MLH3، TEX11، ناباروری، پلیمورفیسم
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
  • تعیین مهم ترین صفات تعیین کننده عملکرد ارقام مختلف برنج در شرایط نرمال و تنش خشکی
    محمدرضا کریم، حسین صبوری*، محمدعلی ابراهیمی، سمیه سنچولی صفحات 43-57
    به منظور ارزیابی اثر تنش خشکی بر عملکرد و تعدادی از صفات وابسته به آن، 14 ژنوتیپ برنج (شامل 5 رقم بومی و 9 رقم خارجی) در قالب طرح بلوک کامل تصادفی در سه تکرار در دو محیط بدون تنش (غرقاب) و تنش خشکی در مزرعه تحقیقاتی واقع در شهرستان علی آباد کتول (زیر نظر دانشگاه‏ گنبدکاووس) مورد مطالعه قرار گرفت. آبیاری مزرعه آزمایشی در هر دو محیط غرقاب و تنش، تا مرحله پنجه دهی ارقام به طور یکسان به صورت غرقاب انجام شد، سپس برای ایجاد تنش، آبیاری از 40 روز پس از نشاء (مرحله حداکثر پنجه زنی) به فاصله هر 25 روز تا پایان فصل زراعی انجام شد. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که تفاوت معنی داری بین ژنوتیپ ها از نظر کلیه صفات مورد مطالعه در دو شرایط مطالعه وجود داشت. بیشترین میانگین عملکرد در شرایط نرمال و تنش متعلق به ژنوتیپ های lR83752-B-B-12-3 و سپیدرود بود. وزن خوشه (**85/0) در شرایط بدون تنش (غرقاب) و حجم ریشه (**98/0) در شرایط تنش خشکی، بالاترین همبستگی مثبت و معنی-داری را با عملکرد دانه داشتند. نتایج تجزیه علیت نشان داد که در شرایط بدون تنش، تعداد خوشه و در شرایط تنش خشکی، تعداد دانه پر خوشه دارای بالاترین اثر مستقیم و مثبت بر عملکرد دانه داشتند. در گروه بندی ارقام بر اساس تجزیه کلاستر با استفاده از روش ward، ارقام در شرایط نرمال و تنش در سه گروه قرار گرفتند. نتایج تجزیه کلاستر نشان داد که ارقامIR83752-B-B-12-3 ، Pegaso و سپیدرود که دارای حجم، وزن تر و وزن خشک ریشه بیشتری نسبت به ارقام دیگر بودند در گروه متحمل به خشکی قرار گرفتند.
    کلیدواژگان: تنش خشکی، تجزیه خوشه ای، تجزیه علیت، برنج، صفات مورفولوژیکی
    چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی
|
  • Identification of the resistant bacterial strains from Kermanshah oil wastewater based on molecular 16S rDNA PCR ssequencing and the investigation of their growth in different chromium concentration
    Sepideh Khodamoradi *, Ramin Abiri Pages 1-10
    The present study was conducted to identify the resistant bacterial strains from Kermanshah oil wastewater based on molecular 16S rDNA PCR sequencing and the investigation of their growth in different chromium concentration. To identify 16S rDNS, 94 samples were isolated from Kermanshah oil wastewater. Sequencing the best strain for most removal was conducted. Bactria were identified by morphology, Gram staining, Biochemical tests, Standard microbiology. Cr (VI) was incubated in the concentrations of 25, 50, 100 and 150 mg/ml for 96 h. The maximum Cr biosorption (0.35 ppm) was observed at 28°C and a pH=7.5-8. Biological oxygen demand was 126-530. The most isolates had a need from 7.2-7.90 for chemical oxygen demand. Based on obtained results, Klebsiella variicola, Bacillus aerius, Bacillus stratosphericus and Lysinibacillus fusiformis were most resistant strains. Bacteria growth was higher in control, 25, 50, 100 and 150 mg, respectively. All the bacteria showed a fix growth after 72h. Considering high resistant of Klebsiella variicola, Bacillus aerius, Bacillus stratosphericus and Lysinibacillus fusiformis, the strains can be used for bioremediation of chromium and decreasing aontaminations, especially in oil refinery.
    Keywords: chromium, Bioremediation, Oil refinery, Kermanshah, Biological oxygen demand
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
  • Effect of diclazuril on growth performance in broilers with Eimeria tenella
    Hamed Zarei *, Mostafa Shah Hosseini Pages 11-16
    One of the most important protozoan diseases in poultry industry is coccidiosis, and eradication of disease has become one of the most challenging issues in animal husbandry and veterinary medicine. The damages resulted from coccidiosis to poultry industry is estimated $ 1 billion annually. Diclazuril, a benzene acetonitrile, is used to treat coccidiosis in poultry. In the following study, 90 one-day-old broilers were bred and categorized into 3 groups as follows: Group 1: Recipient of basal diet for the whole period of test. Group 2: Broilers with basal diet + 0.25 ml suspension including 30,000 Eimeria tenella oocysts from 14 days of age (oral inoculation). Group 3: Recipient of basal diet + 0.25 ml suspension including 30,000 Eimeria tenella oocysts from 14 days (oral inoculation) + diclazuril, a coccidiostat, (200g/ton) from one day. From each group, at 28 and 49 days of age, 9 broilers were randomly selected and their growth performance and carcass characteristics were assessed. Diclazuril could improve the growth performance in boilers with coccidiosis.
    Keywords: Diclazuril, Coccidiosis, growth performance, Eimeria tenella
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
  • The Study of Herpes Simplex 1 and 2 and Cytomegalovirus Viruses in Patients with Alzheimer Disease
    Sepideh Khodamoradi *, MohammadHassan Shahhosseiny, Taher Mohammadian, Atousa Ferdousi Pages 17-22

    Different environmental factors, such as infection have cause Alzheimer's disease. Studies have shown that Herpes simplex 1 and 2 and cytomegalovirus viruses have relations with Alzheimer disease. Human cytomegalovirus viruses (CMV) induces infection in central nervous system. It is need a study investigating the relation between different viruses with Alzheimer. The current study, investigates the relation between different viruses Alzheimer. In this study, 100 patients with Alzheimer were studied and blood samples were collected (1.5 ml per patient). Following extraction of viral DNA, the samples were investigated by PCR method. The data for peoples with positive PCR were analyzed by Kruska-Walis test of SPSS software (version 23). The prevalence of CMV, HSV2 and HSV1 was observed in 27, 8 and 4 people that means 27%, 8% and 4%. These results suggest that CMV infection is associated to increased risk of AD and a quick rate of cognitive decline in elderly populations. In sum, all the studied viruses were identified, but cytomegalovirus virus had higher frequency.

    Keywords: Herpes virus, Cytomegalovirus, Alzheimer, Prevalence
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
  • Identification of fish in southeastern water resources of Tehran province (Varamin region)
    Sahar Sattarvand, Siamak Yousefi Siahkalroodi * Pages 23-30
    In the present study, species diversity and abundance of water resources in the southeast of the province were identified and studied for 6 months. Five stations were selected and fishes were caught to various means such as gill net, manual net and, electro hemlock were caught a monthly basis and transferred to the laboratory. Their identified using reliable identity keys. The aim of this survey was to genus identify and fish species, their time and spatial distributions and abundances in the region. Result indicated that 3 families, 6 genus and 9 species were identified that 4 genus and 6 spceies belong to the cyprinidae family. The family balitorada with 2 spceies was next standing. The last family in the research poecilidae family with one genus and one spceies of gambusia holbrooki has been found.
    Keywords: Eastern of Tehran province, Species, fish, abundant, Variety
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
  • The study of the association of two variants of MLH3(rs175080) andTEX11(rs6525433) in Iranian infertile men
    Hanieh Sezavar, Zahra Noormohammadi *, Masoud Sheidai Pages 31-41

    Infertility is one of the most common problems in human societies which estimated between 1 in 6 couples worldwide. It is a complex clinical condition caused by the interaction of genetic and environmental factors. The TEX11 and MLH3 gene plays a key role in the mechanism of DNA repair and crossing over.

    Methods

    In this study, the association of two SNPs of MLH3 (rs175080) and TEX11 (rs6525433) in Iranian infertile men was investigated. One hundred twenty infertile men with azoospermia and 115 healthy individuals were collected as a control. These two polymorphisms were investigated by using tetra-amplification refractory mutation system ((PCR), TETRA - ARMS – PCR), PCR – RFLP, and sequencing were used. Findings and

    Discussion

    The frequency of GG and GA genotypes in MLH3 gene was 30.9% and 69.1% in azoospermia males and 31.3% and 68.7% in the control group (P = 0.619), respectively. The result showed that rs175080 polymorphism in the MLH3 gene and rs6525433 polymorphism in the TEX11 gene were not associated with the risk of Azoospermia.

    Keywords: azoospermia, Male infertility, polymorphism, TEX11 gene, MLH3
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
  • Determination of most effective traits on rice yield under normal and drought conditions
    Mohammadreza Karim, Hossein Sabouri *, Mohammadali Ebrahimi, Somayyeh Sanchouli Pages 43-57
    In order to evaluate the effect of drought stress on yield and the other related traits, 14 rice genotypes (including five varieties of landrace and introduced varieties) in a randomized complete block design with three replications in two environments without stress (flooding) and drought stress in the field Research located in Aliabad (under the supervision of Gonbad Kavous University) was studied. Irrigation of experimental farm in both the flood and drought were flooded until maximum tillering stage. Irrigation was performed every 25 days until the end of the season from 40 days after maximum Tillerin). Analysis of variance showed significant differences among genotypes for all traits in both conditions. The average yield of the genotypes in the normal and stress conditions lR83752-BB-12-3 and was Sepedroud. Panicle weight (0.85**) under stress (flooding) and root volume (0.98**) in drought stress conditions, the highest positive correlation with grain yield were Significant. Path analysis results showed that different traits were involved in justifying grain yield under non-stress and drought stress conditions, so that in non-stress condition, number of panicle and in drought condition, number of filled grain per panicle had the highest direct and positive effect on grain yield. In grouping cultivars based on cluster analysis using ward method, cultivars were divided into three groups under normal conditions and stress. The results of cluster analysis showed that Pegaso, IR83752-B-B-12-3 and Sepidrood cultivars, which had more volume, fresh weight and root dry weight than other cultivars, were in the drought tolerant group.
    Keywords: Drought stress, Cluster analysis, Path analysis, Rice, Morphological
    Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian