فهرست مطالب

نشریه دانش زیستی ایران
سال پانزدهم شماره 2 (تابستان 1399)

  • تاریخ انتشار: 1399/06/20
  • تعداد عناوین: 6
|
  • حسین زینلی، معصومه حسن بارانی* صفحات 1-7
    این تحقیق به منظور بررسی تاثیر زمان آبیاری و میزان کود فسفر بر عملکرد و اجزای عملکرد دانه گیاه، در سال 1387درمزرعه تحقیقاتی سپاهان نما واقع در جیلان آباد اصفهان و به صورت کرت های خرد شده در قالب طرح بلوک کامل تصادفی با 3 تکرار اجرا گردید. تیمار های مورد بررسی شامل زمان آبیاری 50، 100 و 150 میلی متر تبخیر از تشت تبخیر در کرت های اصلی و سطوح مختلف کود فسفر (صفر، 75 و 150 کیلوگرم در هکتار) در کرت های فرعی بود. صفات تعداد کپسول در بوته، تعداد دانه درکپسول، وزن دانه در کپسول، وزن هزار دانه، عملکرد بیولوژیک، عملکرد دانه در متر مربع و ارتفاع گیاه اندازه گیری و ثبت شد. نتایج نشان داد که کلیه صفات مورد مطالعه به طور معنی داری تحت تاثیر زمان آبیاری، سطوح مختلف فسفر و اثر متقابل کود فسفر و زمان آبیاری قرار گرفتند. بیشترین عملکرد دانه در واحد سطح در تنش رطوبتی 100 میلی متر تبخیر از تشت تبخیر و مصرف 150 کیلوگرم در هکتار کود فسفر و کمترین میزان عملکرد دانه در تیمار آبیاری 150 میلی متر تبخیر از تشت تبخیر و مصرف 150 کیلوگرم کود فسفر بدست آمد.
    کلیدواژگان: کود فسفر، عملکرد بیولوژیک، سیاهدانه، آبیاری
  • سینا سادات امامی*، جمیله نوروزی، رامین عبیری، پرویز مهاجری صفحات 9-19
    هدف

    شناسایی مولکولی باکتری استنوتروفوموناس مالتوفیلیا جدا شده از نمونه های بالینی و محیطی بیمارستان های کرمانشاه

    روش کار

    500 نمونه بالینی و محیطی مختلف جمع‏آوری و توسط تست‏های بیوشیمیایی و PCR شناسایی شد. در مرحله بعد سویه های باکتری با تکثیر 7 لوکوس ژنی شامل atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA و recA مشخص و تعین توالی شد. رسم درخت فیلوژنی مربوط به سویه ها با نرم افزارMEGAv.7 صورت گرفت.

    نتایج

    از میان500 نمونه‏ جمع‏آوری شده از بیمارستان ها، تعداد 28 ایزوله استنوتروفوموناس مالتوفیلیا شناسایی شدند. از این میان 13 ایزوله مربوط به نمونه های محیطی (7 ایزوله (8/53%) از محیط های مرطوب و 6 ایزوله (2/46%) از محیط های خشک) و 15 ایزوله نیز مربوط به نمونه های بالینی (12 ایزوله (80%) از نمونه خلط بیماران و 3 ایزوله (20%) از خون بیماران) بودند. در تعداد اندکی سویه مشترک نیز میان نمونه های بالینی و محیطی یافت شد. بر اساس درخت فیلوژنی، 28 ایزوله جمع آوری شده مربوط به 21 سویه شناسایی شده از باکتری است که به دلیل شباهت ژنتیکی 100 % برخی از ایزوله ها بوده است.

    بحث و نتیجه گیری

    تمام سویه های در حال گردش باکتری استنوتروفوموناس مالتوفیلیا در شهر کرمانشاه متعلق به یک الگوی ملکولی خاص بوده و از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار نمی باشند که احتمال آلودگی بیماران به باکتری را از طریق محیط های آلوده بیمارستانی افزایش می دهد. بنابراین استفاده از روش های ملکولی افتراقی با قدرت بالا به عنوان روش قابل قبول در کنترل این باکتری پیشنهاد می گردد

    کلیدواژگان: استنوتروفوموناس مالتوفیلیا، شناسایی مولکولی، عفونت بیمارستانی، ژن های خانه دار
  • نازنین زند*، دنیا محمد ظاهری، لیلا ناطقی صفحات 21-35

    در این تحقیق اثر سه نوع فیلم قابل انعطاف چند لایه و غلظت های مختلف سه نوع مخلوط گازی (دی اکسیدکربن، نیتروژن، اکسیژن) و نیز شرایط تحت خلاء و شاهد برای افزایش زمان ماندگاری پنیر لیقوان در شرایط دمای محیط (0C25) مورد بررسی قرار گرفت. بسته بندی شاهد با 4 نوع بسته بندی با اتمسفر اصلاح شده با ترکیب های گازی (70 درصد CO2 و 30 درصد N2) و (30 درصد CO2 و 70 درصد N2) و (5/47 درصد N2 و 5/47 درصد CO2 و 5 درصد O2) و تحت خلاء مقایسه گردید. برای بسته بندی نمونه ها ازفیلم قابل انعطاف، لفاف 3 لایه PET(12) /AL (12)/ LLD (100) لفاف 4 لایه، PET (12) /AL (7) /PET (12) / LLD (100) و لفاف 3 لایه PET (12) /AL (7) /LLD (100) استفاده شد. نمونه های بسته بندی شده، در زمان های مختلف (بیست روز) در روزهای 5، 10، 15 و 20 مورد آزمون میکروبی (شمارش کلی میکروارگانیسم ها وشمارش کپک ها و مخمر ها و شمارش کلی فرم) و آزمون شیمیایی pH قرار گرفتند. نتایج در قالب طرح کاملا تصادفی توسط نرم افزار آماری SPSS وژن 22 و به روش آزمون چند دامنه ای دانکن (p <0.05) انجام گرفت. استفاده از MAP برای کنترل فساد کافی نبود، اما روند فساد را به تاخیر انداخت. طبق نتایج بهترین شرایط نگهداری متعلق به نمونه های موجود در لفاف چهار لایه با نفوذپذیری و عبور بخار آب کمتر به همراه ترکیب گازی (70 درصد CO2 و 30 درصد N2) به دلیل خاصیت میکروبی بالاتر است که تا 20روز عمر ماندگاری پنیر لیقوان افزایش داد و تاثیر مطلوب تر بر میزان pH داشت .

    کلیدواژگان: بسته بندی تحت اتمسفر اصلاح شده، جمعیت میکروبی، پنیر لیقوان، لفاف های انعطاف پذیرچند لایه
  • قاسم حبیبی بی بالانی*، فاطمه موسی زاده صیاد محله صفحات 37-44
    دانش بومی شامل یافته ها و تجربیات گروه های مختلف مردم که در یک منطقه مشخص زندگی می کنند از پیرامون و چگونگی استفاده از اجزای مختلف طبیعت برای رفع مشکلات و موانع موجود در مسیر زندگی در دوران های مختلف می باشد. روستاییان از زمان های طولانی در کاربری گیاهان و درختان در زندگی روزانه دارای پتانسیل فرهنگی و اجرایی فراوان می باشند که بر اساس نوع نیاز اقدام به نامگذاری از بخش های مختلف گیاهان و درختان نموده اند. در این راستا از آنجایی که دهستان بی بالان به عنوان یکی از روستاهایی که در نزدیکی جنگل در شرق استان گیلان، در تقسیم بندی اجزای گیاهی و درختی در دسته بندی های ویژه ای برای جدا کردن کاربری های آنها دارای اصطلاحات ویژه ای می باشند که مورد قبول تمامی گویشوران در این منطقه می باشد. گردآوری اطلاعات در این تحقیق از طریق مصاحبه و مشاهده از طریق پیمایشی صورت گرفت. نتایج این بررسی نشان داد که ساکنان این منطقه دارای تقسیمات و دسته بندی های خاصی برای گیاهان و درختان خودرو منطقه دارا می باشند. این اسامی و دسته بندی ها برای تمامی گویش وران این منطقه مورد پذیرش و قابل استفاده می باشد و منتقل کننده مفهوم خاصی برای هر اسم و یا واژه مورد استفاده است.
    کلیدواژگان: بی بالان، دانش بومی، گیاه، گیلکی، میوه، درخت
  • نیلوفر آقارضائی، فلورا فروزش* صفحات 45-52
    پزشکی دقیق علم جدیدی است که به دنبال استفاده از اطلاعات دقیق و وسیع در مورد تنوع فردی به منظور بهبود در پیشگیری، تشخیص و درمان با استفاده از دارو ایجاد شده است. هدف از این مطالعه مروری بررسی ابعاد مختلفی از چالش های اخلاقی مرتبط با این علم است. در این مطالعه مروری نظام مند پس از جستجو در پایگاه های اطلاعاتی مانندPubMed ، ISI و Scopus با بررسی هدفمند متون در رابطه با اخلاق در پزشکی دقیق، در مجموع 47 مقاله جمع آوری گردید که از میان آن ها 38 مقاله انتخاب و مورد بررسی قرار گرفت. از بررسی مجموع مطالعاتی که معیار ورود به مطالعه حاضر را داشتند، این مهم بر می آید که برخلاف اینکه در نگاه اول به نظر می رسد تحقق اهداف شگفت انگیز پزشکی دقیق و رشد آن نیازمند سرمایه گذاری های کلان در بلند مدت دارد و با چالش-های اقتصادی رو به روست، ولی موانع ترویج پزشکی دقیق چالش های فرهنگی است. تنها راه حل، تلاش طرفداران این علم برای درک و پذیرش موانع اخلاقی، اقتصادی و سیاسی به منظور تغییر فرهنگ برای ارتقا پزشکی دقیق است. بررسی ها نشان می دهد که پزشکی دقیق درصورتیکه در چهارچوب اخلاقیات چه در زمینه پژوهش و چه در زمینه تشخیص و درمان موثر افراد به پیش رود، می تواند دریچه ای نوین از مراقبت های بهداشتی با عملکردی بسیار بهینه تر از گذشته ایجاد کند. به طوریکه می-توان انتظار داشت در آینده ای نه چندان دور شاهد پیشرفت سریع این علم هم در حوزه تحقیقات و هم در حوزه بالین باشیم.
    کلیدواژگان: پزشکی دقیق، اخلاق پزشکی، اخلاق پژوهش، اخلاق
  • مهدیه احمدی، اکرم عیدی، حسن احمدوند*، مجتبی خاکساریان، فتاح ستوده نژاد نعمت اللهی صفحات 53-61

    مالتیپل اسکلروزیس شایع ترین بیماری نورولوژیکی است که با التهاب و تخریب آکسونی در سیستم عصبی مرکزی مشخص می شود. کارواکرول یک ترکیب فیتواستروژنی ارزشمند است و نتایجی درمورد اثربخشی آن در زمینه کاهش التهاب و حفاظت از نورون به دست آمده است. هدف از این مطالعه بررسی اثر کارواکرول بر بیان ژن های IL-10, foxp3, IL-4 و TGF-β در نخاع موش های صحرایی مدل EAE (Experimental Autoimmune Encephalomyelitis)، به عنوان مدل حیوانی مالتیپل اسکلروزیس می باشد. EAE در موش های صحرایی ماده لویس القاء شد. موش ها به سه گروه کنترل، مدل EAE و گروه EAE تحت تیمار با کارواکرول دسته بندی شدند. کارواکرول به صورت روزانه و داخل صفاقی از روز 12 تا 29 بعد از ایمنی زایی تزریق شد. از بافت نخاع RNA استخراج گردید و تغییرات بیان ژن های IL-10, foxp3, IL-4 و TGF-β به وسیله ریل تایم پی سی آر بررسی شد. نتایج نشان داد القاء مدل آزمایشگاهی مالتیپل اسکلروزیس در موش ها باعث کاهش بیان ژن های ضد التهابی IL-1 ، IL-4 و TGF در بافت نخاع شد وتیمار موش های مدل با کارواکرول باعث افزایش معناداری در بیان ژن IL-10 شد (0.0001> P) و در بیان ژن های IL-4 و TGF-β تاثیر مثبتی مشاهده نشد. همچنین میزان بیان ژن foxp3 در گروه مدل، دارای افزایش چشمگیری بود (0.0001> P) که تیمار با کارواکرول این مقدار را کاهش داد. با اثرگذاری کارواکرول بر افزایش بیان ژن IL-10، کاهش التهاب موضعی و افزایش پاکسازی نخاله های حاصل از آن، محیط تهاجمی که برای نورون ها ایجاد شده است را به یک محیط امن تبدیل می کند و رمیلیناسیون به راه می افتد.

    کلیدواژگان: کارواکرول، مالتیپل اسکلروزیس، التهاب، موش صحرایی
|
  • Hossein Zeinali, Masoomeh Hasanbarani * Pages 1-7
    Abstract. This investigation carried out in order to study the effects of irrigation times and phosphorous fertilizer on yield and yield components on Nigella sativa in split plot design with three replications based on randomized complete block designed at Sepahan Nama research farm in Jellan Abad of Isfahan. The main factor was irrigation time with three levels including 50, 100 and 150 mm evaporation from flash tank of A class. The sub plot was different phosphorous fertilizer levels including control, 75 and 150 kg/ ha P (triple super phosphate fertilizer). Measured traits were including number of capsule per plant, number of seed per capsule, seed weight to capsule, 1000-seed weight, biological yield, seed yield per meter squares and plant height. Variance analysis showed that all traits had significant differences for different levels of irrigation time, phosphorous fertilizer and interaction them. Result described which the highest biological, seed yield per plant and area obtained at 100 mm evaporation and 150 kg/ h P and the lowest these traits was obtained at 150 mm evaporation from flash tank and 150 kg/ha P. Result showed to production of suitable yield must be attended to irrigation parameters and consumption of phosphorous fertilizer. Also result described which more and less use of irrigation is not suitable for high production of seed yield.
    Keywords: phosphorous fertilizer, Biological yield, Nigella sativa, Water stress
  • Sina Emami *, Jamileh Nowroozi, Ramin Abiri, Parviz Mohajeri Pages 9-19
    aim

    the molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environments in Kermanshah was studied

    Methods

    500 different clinical and environmental samples were collected and cultured for isolation and identification of S.maltophilia isolates using biochemical tests; then presence of 23srRNA gene was detected by PCR for molecular identification. Finally, by amplifying 7 housekeeping genes (including: atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA and recA) in relation with S.maltophilia bacterium, the strains of S.maltophilia isolates were determined. Then phylogenetic tree was drawn by Mega 7 software.

    Results

    From 500 clinical and environmental samples collected from hospitals, 28 isolates of S.maltophilia were identified by biochemical methods and molecular confirmation. Among these, 13 isolates were obtained from environmental samples and the rest from clinical samples. A small number of common strains were also found between clinical and environmental samples. Phylogenetic tree analysis demonstrated that these 28 isolates belonged to 21 identified strains of the S.maltophilia, which was due to 100% genetic similarity of some isolates.

    Discussion

    The molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environment revealed that all strains of this bacterium in Kermanshah belong to a specific molecular pattern and do not have high genetic diversity and probably, this bacterium was transmitted from the hospital to patients. Therefore, observance of hygiene in hospital and employing the molecular methods with high differentiation is recommended to control the distribution of this bacterium.

    Keywords: Stenotrophomonas maltophilia, Molecular identification, Housekeeping genes, hospital environment
  • Nazanin Zand *, Donya Mohammad Zaheri, Leyla Nateghi Pages 21-35

    In this project, the effect of three types of flexible multilayer films and different concentrations of three types of gaseous mixtures (carbon dioxide, nitrogen, oxygen) as well as conditions under vacuum and also ordinary conditions as control to increase the shelf life of Liquvan cheese at ambient temperature (250C) were evaluated. Non-gas injection packaging as a control sample were compared with four type of modified atmosphere packaging (70% CO2 + 30% N2) , (30% CO2 + 70% N2) , (47.5% N2 + 47.5% + 5% O2) and under vacuum. For packing samples were used different flexible multi-layer films, 3-layer{PET(12)/ AL(12)/LLD (100)},4-layer {PET(12)/AL(7) /PET(12)/LLD (100) } , and 3-layer { PET(12)/ AL(7)/LLD (100)}. Experiments were performed on samples as follows microbial test (aerobics count; mold and yeast count ; coliform count and chemical pH test, at different times 5,10 15,20 (during twenty days). The results were performed in a completely randomized design by SPSS (Ver:22) and Duncan’s new multiple range test, with confidence level of 95% (P <0.05). Using MAP was not enough to control spoilage, but it was delayed the spoilage process. Therefore, the using of packaging with 4-layers as a low water vapor transmition and gas composition (70% CO2 + 30% N2) as a high antimicrobial properties were used to maintain the long-term of Liquvan cheese during twenty days and have a good effect on the amount of pH was better.

    Keywords: Modified Atmospheric Packaging, Microbial population, Liquvan Cheese, flexible multi-layer films
  • Ghassem Habibi Bibalani *, Fatemeh Mosazaded Sayadmahaleh Pages 37-44
    Indigenous knowledge includes the findings and experiences of different groups of people living in a particular area and how to use different components of nature to solve problems and obstacles in the way of life in different eras. Villagers who have a long time in the use of plants and trees in daily life have great cultural and administrative potential, which have named different parts of plants and trees based on the type of need. In this regard, since Bibalan village is one of the villages near the forest in the east of Gilan province, the divisions of plant and tree components in special categories to separate their uses have special terms, which are accepted by all there are speakers in this area. Data collection in this study was done through interviews and observation through a survey. The results of the study showed that the inhabitants of this region have special divisions and categories for the plants and trees of the region. These names and categories are accepted and usable for all dialects of this region and convey a specific meaning for each name or word used.
    Keywords: Bibalan, Indigenous knowledge, Plant, Gilaki, fruit
  • Niloofar Agharezaee, Flora Forouzesh * Pages 45-52
    Precision medicine is a new science that applies a broad and accurate order of information on individual diversity to improve prevention, diagnosis, and treatment by medication. The aim of this review study was to examine the various dimensions of the ethical challenges associated with this science. In this study after searching in databases such as PubMed, ISI and Scopus, 47 articles were obtained by exploring the purposeful texts on ethics in precision medicine, among which 38 articles were selected for review. From the survey of the total number of studies that were the criteria for entering this study, it is important that despite the fact that at first glance, the realization of the amazing goals of precision medicine and its growth requires large investments in the long run and with the economic challenges but the obstacles to the promotion of medical precision are cultural challenges. The only solution to the efforts of the advocates of this science is to understand and accept the ethical, economic, and political barriers to changing the culture for precision medicine upgrading. Studies show that precision medicine can provide a healthier alternative to healthcare with much better performance than it used to be, in the ethical framework, both in research and in the field of effective diagnosis and treatment. In the near future, we can expect rapid progress in science both in the field of research and in the clinical field.
    Keywords: Precision Medicine, Medical Ethics, Ethics of research, Ethics
  • Mahdie Ahmadi, Akram Eidi, Hassan Ahmadvand *, Mojtaba Khaksarian, Fattah Sotoodehnejadnematalahi Pages 53-61

    Multiple sclerosis is a common neurological disorder that is characterized by inflammation, axonal destruction, and atrophy of the central nervous system. Carvacrol is a valuable phytoestrogenic compound that has been shown thus far to be effective reducing inflammation and protecting neurons. The aim of this study was to evaluate the effect of carvacrol on the expression of IL-10 FOX-P3, IL-4, and TGF-β genes in the spinal cord of EAE (Experimental Autoimmune Encephalomyelitis) rats as an animal model of MS. EAE was induced in female Lewis rats and they then were divided into three groups: control, EAE model, and EAE treated with carvacrol. Carvacrol was injected daily intraperitoneally from days 12 to 29 after immunization. RNA was extracted from rat spinal cord tissue and changes in the expression of the IL-10, FOX-P3, IL-4, and TGF-β genes were examined by real-time PCR.The results showed induction of the MS experimental model in the Lewis rats decreased expression of the IL-10, IL-4, and TGF anti-inflammatory genes in spinal cord of rats. Treatment of EAE rats with carvacrol significantly increased IL-10 gene expression(p < 0.001), but showed no positive effect on the expression of the other two genes. The expression of the FOX-P3 gene in the model group increased significantly(p < 0.001), but this decreased after carvacrol treatment. With the effect of carvacrol on increasing IL-10 gene expression, reduce local inflammation and increase debris clearance, converts the invasive environment created for neurons into a safe environment and triggers remyelination.

    Keywords: Carvacrol, Multiple Sclerosis, Inflammation, Rat