کبوترخانه ها به علت قدمت و حضور مستمر و موثر در معماری بومی از نظر علوم تجربی هم اهمیت زیادی دارند که از جمله آن می توان به رعایت و به کارگیری اصول مربوط به حرکت، تشدید و لرزه ناشی از پرواز و تحرک کبوتران، اعمال اصول بیشینه سطح محاط در حجم معماری داخلی آن ها، شناخت ظرافت های رفتاری جانوران میزبان در جلب و جانوران مهاجم در دفع، اعمال اصول مربوط به تناسبات و زیبا شناسی احجام، علم مربوط به شناخت مصالح و به کارگیری مواد اشاره کرد.