تشخیص سیانوباکتری های تولیدکننده ی میکروسیستین در تالاب انزلی با استفاده از روش PCR

شکوفایی سیانوباکتری ها در آب های سطحی منجر به تولید سیانوتوکسین های خطرناکی مثل میکروسیستین می شود که مشکلات قابل توجهی ایجاد می کنند. در مطالعه ی حاضر، از یک آزمون PCR بهینه شده برای شناسایی سیانوباکتری های تولید کننده ی میکروسیستین موجود در تالاب انزلی استفاده شده است.
نمونه گیری آب از 20 ایستگاه واقع در نواحی شرقی، مرکزی و غربی تالاب انزلی صورت گرفت. استخراج DNA با استفاده از کیت DNG-Plus انجام گرفت. آزمون PCR برای پرایمرهای جهانی سیانوباکتری ها (23S30R و CYA106F) و پرایمر اختصاصی ژن کدکننده ی میکروسیستین (mcyA-Cd1F و mcyA-Cd1R) بهینه شده و حساسیت و اختصاصیت آن ارزیابی گردید. سپس، آزمون PCR بهینه شده برای نمونه های تالاب انزلی به کار گرفته شد. فرایند کلونینگ محصولات PCR با توجه به رهنمودهای سازنده ی کیت انجام گرفت.
مناسب ترین دما برای مرحله ی انیلینگ، واکنش 56 درجه سانتی گراد بود. بیشترین میزان تکثیر DNA زمانی در غلظت 4/0 میکرومولار پرایمرها مشاهده شد. به کارگیری آزمون PCR بهینه شده روی نمونه های تالاب انزلی آشکار کرد که همه ی ایستگاه های مورد مطالعه، آلوده به سیانوباکتری بودند که از بین آنها، سیانوباکتری های تولید کننده ی میکروسیستین در 10 ایستگاه حضور داشتند. محصولات PCR با موفقیت کلون شده و برای مطالعات آتی ذخیره گردید.
ممکن است تالاب انزلی در معرض خطر غلبه سیانوباکتری ها قرار گرفته باشد. از آزمون PCR بهینه شده در این مطالعه می توان به عنوان یک ابزار کارآمد به منظور مونیتورینگ و کنترل سیانوباکتری ها، به خصوص جهت شناسایی سویه های تولید کننده ی میکروسیستین در تالاب ها و یا سایر منابع آبی استفاده کرد.