طراحی مهارکننده های جدید پپتیدی با گروه های عاملی بر پایه بنزن برای پروتئاز ویروس HTLV-1 با روش های محاسباتی

ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس ها می باشد، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی T-Cell بزرگسالان (ATL)، HAM/TSP و... می گردد. یکی از پروتئین های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می باشد. مهارکننده هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده اند، فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده اند. در این مطالعه سری جدیدی از مهار کننده ها ایجاد و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروتئین پروتئاز سنجیده شد. ترکیبات بر اساس مشابهت با پپتید اصلی و بر پایه پپتیدوممتیک ایجاد گردیدند. ترکیبات بوسیله نرم افزار هایپرکم بوجود آمدند و عمل بهینه سازی بر روی لیگاندهای طراحی شده و لیگاندهای همراه با پروتئین که دارای ساختار کریستال بودند، بعد از جدا کردن آن ها انجام گردید. ADME و ویژگی سمیت ترکیبات با استفاده از برنامه های تحت وب http://www.molinspiration.com و http://lazar-services.in-silico.ch تعیین و عمل داکینگ بر روی آن ها انجام گردید.
بررسی های ADME ترکیبات طراحی شده نتایج مناسبی را ارائه دادند. بررسی ها حاکی از سمیت نسبتا مناسبی برای لیگاندهای طراحی شده بودند.
نتایج بدست آمده از داکینگ نیز نشانگر اختصاصی بودن لیگاندهای طراحی شده در مهر پروتئاز بودند. در نهایت این که نتایج نشان دادند مهارکننده های طراحی شده می توانند به عنوان ترکیبات مشابه، داروی موثری برای مهار این پروتئین بوده ودر مقابله با این ویروس بکار روند.