شناسایی و مقایسه توالی ~
~
ژن VP28 ویروس لکه سفید میگو، جداشده از میگوی وانامی در چابهار (ایران)

عفونت ویروس سندروم لکه سفید (WSSV)، باعث خسارات زیادی در تولید و اقتصاد فرهنگ میگو در سطح جهان است. برای اولین بار بیماری لکه سفید (WSD) در سال 2004 در بوشهر و در سال 2008 در سیستان و بلوچستان گزارش شده است. ویروس لکه سفید میگو در بین ویروس های آلوده کننده میگو های پنائیده بسیار بیماری زا است.
نمونه های DNA ویروس لکه سفید میگو از میگو های بیمار به دست آمد. از آغازگر اختصاصی PCR برای تکثیر ژن VP28 در WSSV مورد استفاده قرار گرفت. ژن VP28 از DNA جداشده از WSSV توسط PCR تکثیر شد و محصول PCR تعیین توالی شد.
محصول توالی یابی شده به شماره ثبت (KF723558) در بانک جهانی ژن ثبت شد. توالی نوکلئوتیدی (KF723558) با توالی های ژن VP28 در پایگاه داده NCBI مقایسه شد.
36 توالی هم ترازی قابل توجهی با 99٪ شباهت که شامل توالی هایی از کره، ژاپن، ایالات متحده، اندونزی، چین، ویتنام، تایوان، هلند و تایلند نشان داد. با این حال همسانی 100٪ در توالی ها مشاهده نگردید.