بررسی شبکه پروتئینی پروتئین های دخیل در بیماری قلبی-عروقی

بیماری قلبی- عروقی (Cardiovascular disease) که قلب و رگ های قلبی را شامل می شود، جزء شایع ترین علل مرگ ها در جهان است و متاسفانه محدودیت در تشخیص زودرس بیماری وجود دارد. در این مطالعه، شبکه پروتئینی به منظورکشف بیومارکرهای اختصاصی برای تشخیص زودرس بیماری و معالجه به موقع بررسی گردید.
در این مطالعه، پروتئین های دخیل در بیماری قلبی-عروقی با استفاده از پایگاه های داده Polysearch، OMIM و Wiki pathway جمع آوری و سپس این پروتئین ها روی شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین منطبق شدند. آنالیز توپولوژیکی زیرشبکه توسط نرم افزار 3 .3 Cytoscape انجام شد. پارامترهای درجه راس و betweenness برای معرفی مارکرهای کاندید در نظر گرفته شدند.
پس از آنالیز توپولوژیکی شبکه، پروتئین های با درجه راس بالا به عنوان hub و پروتئین های با betweenness بالا به عنوان bottleneck شناخته شدند. 3 پروتئین hub-bottleneck که مرکزیت بالا در شبکه داشتند، به عنوان مارکرهای کاندید معرفی شدند.
کاندیداهای پروتئینی برای بیماری قلبی- عروقی IL6، MMP9 و AKT1 معرفی شدند که می توانند بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف دارویی برای این بیماری باشند. علاوه بر این، مسیرهای بیوشیمیایی برای پروتئین های زیر شبکه با بالاترین امتیاز شامل تنظیم منفی انتقال یون، سنتز کلاژن، تخریب پلاکت و فروپاشی ماتریکس خارج سلولی می باشد.