متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به منظور شناسایی ژن های کلیدی در بیماری

سرطان دهانه رحم، ازجمله شایع ترین بیماری ها در زنان است. تشخیص دقیق و درمان بیماری های پیچیده نیازمند شناسایی دقیق ویژگی های مولکولی بیماری می باشد. پروفایل های ترنسکریپتومی حاوی اطلاعات با ارزشی در زمینه بیان ژن سلول های موردبررسی می باشد. به کارگیری رویکرد تحلیلی متاآنالیز در کنار روش های مبتنی بر شبکه، اطلاعات دقیق و با ارزشی از داده های موردمطالعه در اختیار قرار می دهد که می تواند در توسعه روش های تشخیصی و درمانی جدید مورداستفاده قرار گیرد. این مطالعه با هدف بررسی متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به منظور شناسایی ژن های کلیدی در بیماری انجام شد.

در مطالعه حاضر، سه مجموعه داده با 189 نمونه برای سرطان دهانه رحم انتخاب شد. مجموعه داده ها به طور جداگانه بررسی و نتایج حاصل در جهت به دست آوردن ژن ها با الگوی بیان یکسان تلفیق گردید. از این ژن ها در مرحله بعد، به منظور ساخت شبکه تنظیمی بیان ژنی به کمک پایگاه داده STRING استفاده شد. جهت شناسایی عناصر کلیدی در شبکه که قابل تعمیم به سرطان دهانه رحم می باشند نیز پارامترهای شبکه (شامل درجه و مرکزیت بینابینی) به کار برده شد.

در این مطالعه، 194 ژن با الگوی بیانی دقیقا یکسان، بین سه مجموعه شناسایی گردید. همچنین با آنالیز شبکه به دست آمده، 12 ژن کلیدی در شبکه تنظیم بیان ژن سرطان دهانه رحم شناسایی شد. (برخی از این ژن ها قبلا به عنوان انکوژن گزارش شده و در مسیر تنظیم چرخه سلولی و مسیرهای ترمیم DNA نقش دارند.)

با توجه به نتایج این مطالعه، این ژن ها می توانند به عنوان مارکرهای بالقوه تشخیصی و درمانی برای درمان سرطان دهانه رحم موردتوجه قرار گیرند.