ارزیابی توان مهارکنندگی ناحیه پروپپتید به عنوان مهارگر کیموتریپسین گوارشی کرم غوزه پنبه،Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae)، بر اساس مطالعه ‏های محاسباتی

کرم غوزه پنبه، Helicoverpa armigera Hübner، آفتی با دامنه میزبانی وسیع است که باعث خسارت اقتصادی شدید روی محصولات کشاورزی در ایران و جهان می ‏شود. در سال های اخیر، حشره‏‏ کش‏‏ های شیمیایی به عنوان موثرترین روش کنترل این آفت استفاده شده اند، ‏که با توجه به اثرات مخرب آن‏‏ها، اغلب پژوهش ها در راستای دستیابی به روشی جایگزین برای کنترل شیمیایی هدایت می ‏ شوند. یکی از رویکرد‏های کارآمد برای کنترل آفات، هدف قرار دادن دستگاه گوارش و به ‏ ویژه مهار آنزیم ‏های گوارشی می‏‏ باشد. در این مطالعه، ما از قطعه پروپپتید آنزیم کیموتریپسین H. armigera به عنوان یک مهارکننده اختصاصی استفاده نمودیم. مدل ساختاری کیموتریپسین حشره از طریق مدل‏‏ سازی همسانی و با استفاده از ساختار کریستالی کیموتریپسین گاوی، Bos taurus L. به عنوان ساختار الگو پیش ‏بینی شد. کیفیت مدل ساختاری حاصل توسط آنالیزهای مختلف از جملهVERIFY_3D ،ERRAT ، PROCHECK،WHAT-IF  و Z-scores مورد ارزیابی قرار گرفت، که نتایج نشان از کیفیت مطلوب مدل پیشنهادی داشت. علاوه بر این، مطالعات شبیه ‏سازی داکینگ مولکولی میان مدل ساختاری پیش‏ بینی شده آنزیم و پروپپتید مهار کننده نشان داد که پروپپتید مهار‏کننده مطلوب‏‏ترین امتیاز داکینگ و انرژی پیوند کل را در هنگام برقرای میان ‏ کنش با جایگاه فعال کیموتریپسین کرم غوزه پنبه دارا می ‏ باشد. با این حال، پروپپتید مهار کننده پتانسیل ضعیفی برای ایجاد میان ‏کنش با کیموتریپسین خوکی، Sus scrofa L.، به عنوان نماینده ‏ای از پستانداران، از خود بروز داد. نتایج حاصل از این پژوهش، اهمیت مطالعه ‏های محاسباتی در طراحی و انتخاب پروپپتید های مهاری مطلوب علیه آنزیم ‏ های هدف را نشان می‏دهد. چنین مهار کننده ‏ هایی می‏ توانند به عنوان جایگزین آفت‏ کش ‏های شیمیایی برای کنترل H. armigera و یا سایر آفات در آینده پیشنهاد شوند.