توالی یابی کامل ژنوم انتروکوکوس فاسیوم EntfacYE بالینی مقاوم به آنتی بیوتیک

  عفونت های انتروکوکی از شایع ترین عفونت های بیمارستانی محسوب می شوند. امروزه انتروکوک ها نسبت به آنتی بیوتیک های رایج به ویژه ونکومایسین مقاومت بالایی از خود نشان می دهند. انتروکوکوس فاسیوم (Enterococcus faecium) مقاوم به ونکومایسین یکی از شایع ترین عفونت های بیمارستانی است که در فهرست پاتوژن های اولویت دار سازمان بهداشت جهانی برای تحقیق و توسعه آنتی بیوتیک های جدید قرار دارد. در این پژوهش، ما برروی ژنوم انتروکوکوس فاسیوم  EntfacYEو ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک آن متمرکز شدیم تا دلایلی را که باعث مقاومت این باکتری در برابر آنتی بیوتیک ها شده است، دریابیم.

  در این مطالعه، یک سویه انتروکوکوس فاسیوم EntfacYE مقاوم به چند دارو از نمونه خون انسان جدا شد. سویه انتروکوکوس فاسیوم جدا شده با استفاده از توالی یابی جزیی فاکتور افزایش طول باکتری Tu به روش سنگر تایید شد. سویه EntfacYE از نظر مقاومت آنتی بیوتیکی بررسی شد و ژنوم باکتری استخراج و توالی یابی کامل گردید. ژنوم توالی یابی شده آنالیز شد و ژن ها در بانک داده های DNA ژاپن ثبت شدند.

  در مجموع، زیرسیستم های ژنومی EntfacYE شامل 23 دسته مختلف با 59 ژن متعلق به ژن های مقاومت ضد میکروبی بود، به طوری که 49 ژن مقاومت آنتی بیوتیکی دارای زیرسیستم های خاص و ده ژن فاقد زیرسیستم های خاص بودند. علاوه بر این، ژن های مقاومت به کادمیوم، کبالت، مس، روی و جیوه در ژنوم EntfacYE شناسایی شدند.

 در نتیجه، مطالعات روی ژنوم باکتری ها به محققان کمک می کند تا ویژگی های پاتوژن های رایج، از جمله ژن های حدت و مقاومت در برابر آنتی بیوتیک را شناسایی کنند و از این رو، با درک پاتوژنز باکتری ها، راه حل های جدیدی برای درمان عفونت های رایج ارایه کنند.