بررسی تنوع ژنتیکی موجود در مولکول های کلیدی سیستم تشخیص الگو (گیرنده های شبه تول دو و چهار) در نمونه های سرطان معده

سرطان معده دومین بدخیمی شایع و عامل اصلی مرگ و میر در کشور است. با در نظر گرفتن آمار جهانی این ارقام بسیار نگران کننده بوده و اهمیت مطالعات در حوزه سرطان معده را برجسته می کند. از آنجایی که سال هاست نقش التهاب مزمن در ایجاد سرطان به خصوص سرطان های مرتبط با عفونت مانند سرطان معده مشخص شده است، تمرکز بر مولکول های دخیل در این فرآیندها می تواند راهگشا باشد. در این میان Toll-like-receptors (TLRs) بزرگترین خانواده گیرنده الگوهای مولکولی مرتبط با التهاب بوده و تاثیر جهش های ایجاد شده در TLR2 و TLR4 در پاتولوژی سرطان معده مشخص شده است. با در نظر گرفتن مطالعات پیشین و نقش عمده TLR4 و TLR2 در فرآیندهای التهابی پیش بدخیمی، در این مطالعه نیز در دو مرحله ی آزمایشگاهی و بیوانفورماتیکی به بررسی جهش موجود در توالی ژن های مذکور و ارتباط آن با سرطان معده پرداخته شده است.

در این مطالعه تعداد 30 نمونه بافت سرطان معده آلوده به هلیکوباکترپیلوری جمع آوری شد و  پس از استخراج DNA، با استفاده از روش های تعیین توالی سنگر و پیش بینی بیماری توسط SIFT، PolyPhen وضعیت پاتوژنی آنها بررسی شد. همچنین توسط PyMOL مدل سازی سه بعدی رسپتور- لیگاند (قبل و بعد از جهش) انجام شد.

 داده ها جهش هتروزیگوتc.1061A>G  در اگزون سوم ژن کد کننده ی TLR4 را نشان دادند. با مدل سازی سه بعدی پروتیین مربوطه دارای این جهش نیز مشخص شد که ناحیه ی متاثر از جهش خارج از منطقه ی میانکش گیرنده مورد بررسی با  LPS بوده و بنابراین پاتوژن نمی باشد.

در مجموع نتایج این پژوهش نشان داد که جهش های اتفاق افتاده بر روی دو ژن مهم سیستم تشخیص الگو در نمونه های سرطانی ایران ارتباط عملکردی با این دو پروتیین نداشته است.