شناسایی، توالی یابی و بررسی فیلوژنی ژن ارتولوگ APETALA1 (AP1) در منداب (Eruca sativa)

گذر از فاز رویشی به زایشی یک مرحله ی نموی مهم، تحت کنترل شدید ژنتیکی است. این تغییر فاز نیازمند فعالیت مجموعه ای از ژنها در مریستم راس شاخساره است که بیان سبب تبدیل مریستم رویشی به زایشی می شود. ژن APETALA1 (AP1) در پیشبرد مرحله ی گذر و نیز تعیین هویت مریستم گل نقش مهمی دارد. شناسایی و هم ساختی (هومولوژی) این ژن و پروتیین استنباطی (Deduced Protein) در گیاه منداب (Eruca sativa) بررسی شد. RNA کل از غنچه های گل منداب استخراج و cDNA ساخته شد. آغازگرهای اختصاصی براساس هم راستایی توالی ژن های هم ساخت AP1 در گیاهان هم خانواده، طراحی و برای واکنش RT-PCR استفاده گردیدند. قطعه مورد نظر به طول 782 نوکلیوتید بود که EvsAP1 نامیده و در پایگاه داده NCBI با شماره KX524132.1 ثبت شد. BLAST این توالی، نشان داد که نزدیک ترین توالی نوکلیوتیدی به EvsAP1 مربوط به گیاه تربچه (Raphanus sativus) و خردل سفید (Sinapis alba) با %87 شباهت است). پروتیین استنباطی ژن EvsAP1، دارای 256 آمینواسید است که %82 شباهت با توالی آمینواسیدی تربچه نشان می دهد. طول کامل پروتیین AP1 در اکثر توالی های پروتیینی ثبت شده از این ژن در سایت NCBI که متعلق به خانواده ی شب بو می باشند، 256 آمینو اسید است که تاییدی برای توالی مورد نظر است. مطالعات درخت فیلوژنی نشان داد که گیاهان هم خانواده Eruca sativa، همگی در شاخه های (کلادهای) مجاور قرار گرفته اند و با خردل سیاه (Brassica nigra) و تربچه (Raphanus sativus) شباهت بالاتری دارد بطوری که با تربچه در یک کلاد قرار دارند که تاییدی بر صحت توالی خوانده شده ژنAP1 در این گیاه می باشد.