نقش عناصر cis-acting ناحیه پروموتر در تنظیم بیان مکان-زمانی ژن NHX1 پاسخگو به تنش شوری در Triticum aestivum L.

شوری خاک یکی از جدی ترین مشکلات در کشت گندم در ایران است که تاثیر زیان آور بر تولید محصول و رشد گیاه دارد. به منظور بررسی ژن های مرتبط با پاسخ به تنش شوری در گندم، تجزیه و تحلیل 3567 برچسب توالی بیان شده (EST) از کتابخانه های برگ و ریشه گندم متحمل به شوری جمع آوری شده از بانک اطلاعاتی دانشگاه هاروارد انجام شد. نرم افزارهای EGassembler، CLCbio و IDEG6 به منظور تجزیه و تحلیل بیان ژن و ابزار طبقه بندی مقایسه ای GoMapMan به منظور دسته بندی کاتالوگ های عملکردی استفاده شد. اختلاف آماری معنی دار بین ژن های دو کتابخانه در 7 گروه کارکردی مشاهده شد. نتایج نشان داد که تبادلگرهای یون NHX1 نقش مهمی در هموستاز یون و تحمل تنش شوری در هر دو بافت برگ و ریشه ایفا می کنند. از آنجا که درک کامل سیستم تنظیم رونویسی ژن به تجزیه و تحلیل عملکردی عناصر cis-acting بستگی دارد، بنابراین عناصر تنظیم کننده موجود در ناحیه '5 تنظیمی ژن های NHX1 با استفاده از پایگاه های داده Plant CARE شناسایی شدند. چندین عنصر تنظیمی مرتبط با فرآیندهای بیولوژیکی، تنظیم هورمونی و پاسخ به تنش ها و محرک های محیطی شناسایی شدند. این پژوهش بینشی در مورد نقش عناصر cis-acting پروموتر در تنظیم بیان مکان- زمانی ژن NHX1 تحت تنش شوری ارایه می دهد.