شناسایی ژن نوکلئوپروتئین جدایه ویروس بیماریزای نیوکاسل ژنوتیپ XIII.2.1

بیماری نیوکاسل عفونتی فوق العاده مسری در طیور است که توسط ویروس بیماری نیوکاسل ایجاد می شود. این بیماری در سرتاسر دنیا به عنوان یکی از مهمترین بیمار یهای ماکیان به حساب آمده و می تواند گاهی باعث مرگ و میر 100 درصدی در طیور مبتلا گردد. با توجه به تلفات ایجاد شده توسط این ویروس، تشخیص بیماری و نیز اطلاع کافی از سویه های در حال گردش ویروسی امری حیاتی به نظر می رسد. در این پژوهش، مطالعات تکمیلی جهت تعیین هویت مولکولی یک جدایه بیماریزا ویروس بیماری نیوکاسل ژنوتیپ XIII.2.1 به نام RT30/2010 که اولین بار از ایران گزارش شده است، انجام گرفته است. در این مطالعه خالص سازی ویروس طی دو مرحله به روش خالص سازی پلاک انجام شد. سپس توالی کامل ناحیه ی کد شونده ژن NP در این جدایه به منظور فراهم سازی اطلاعات تکمیلی برای شناخت ماهیت و همه گیری مولکولی RT30/2010 مورد تحقیق قرار گرفت. برای این منظور ژن NP این ویروس به کمک پرایمرهای اختصاصی تکثیر و در وکتور PTZ57R/T کلون شد. همچنین جهت شناسایی قسمت انتهایی 3 پرایم ژنوم ویروس که شامل ناحیه ابتدایی ژن NP نیز می شود، از روش (Rapid amplification of cDNA ends) RACE استفاده شد. آنالیز فیلوژنتیک و محاسبه فواصل تکاملی توالی کد کننده کامل ژن نوکلیوپروتیین ویروس RT30/2010 بیماری نیوکاسل کلاس II، این ویروس را همراه با سویه هایی از کشور پاکستان در تحت ژنوتیپ XIII.2.1 قرار داد. بنابراین می توان گفت که این ویروس در مقایسه با سایر ویروس های شناسایی شده از ایران دارای خاستگاهی متفاوت است و در دسته ویروس های بیماری نیوکاسل شناسایی شده از پاکستان قرار می گیرد. اطلاعات حاصل از این مطالعه به شناخت بیشتر ویروس کمک کرده و امکان استفاده از این ویروس را به عنوان سویه چلنج و یا استفاده از آن برای ساخت واکسن در برابر ویروس های XIII.2.1 ممکن می سازد.