آنالیزفیلوژنتیکی جمعیتی از گوسفند افشاری با استفاده از توالی HVR-I و cytB میتوکندری DNA

در بین نشانگرهای ژنتیکی، توالی‏یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روش‏ها برای طبقه‏بندی ژنتیکی جمعیت‏ها و گونه‏ های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه‏ های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه‏ ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می‏باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه HVR1 و CytB از ژنوم میتوکندری گوسفند افشاری می‏باشد.

برای انجام این تحقیق تعداد 40 نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوند افشاری جمع‏آوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه HVR1 و CytB توسط پرایمرهای اختصاصی تکثیر شده و تعیین توالی شدند. توالی های به دست آمده با استفاده از برنامه Chromas Lite 2.01 تجزیه و تحلیل شد. جهت تعیین بالاترین همولوژی توالی گوسفند افشاری از رویه Blast تحت پایگاه NCBI استفاده شد.

پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی CytB و HVR1 از ژنوم گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها از مناطق مختلف جهان به ترتیب 3 هاپلوتیپ و 5 هاپلوتیپ مشاهده شد. علاوه بر این هر دو مقر دارای چندشکلی بالایی بودند.

تعیین توالی ژنوم میتوکندری به خوبی می تواند تنوع ژنتیکی و ارتباط خویشاوندی گونه های مختلف گوسفندان را نشان دهد. لذا ابزار قدرتمندی است که می تواند برای بررسی تنوع ژنتیکی سایر نژادهای گوسفندی مورد استفاده قرار گیرد.