مرور سیستماتیک تغییرات ژنتیکی چالش برانگیز واریانت هایکروناویروس سندروم حاد تنفسی 2؛ فرار از سیستم ایمنی و اثربخشی واکسن

تاکنون تحقیقات گسترده ای درباره ویروس کروناویروس سندروم حاد تنفسی 2 و بیماری ناشی از آن در مناطق مختلف جهان انجام شده است. هدف از انجام این مطالعات، ارایه یافته ها و پیشنهادهای کاربردی درباره آشنایی بیشتر با ویژگی های این ویروس، از جمله خصوصیات ساختاری و ژنتیکی، منشا پیدایش، تکامل، تغییرات ژنومی، چرخه بیولوژیک و عملکرد پاتولوژیکی است که می توان آن ها را در اتخاذ راهبردهای کارآمد در کنترل و درمان همه گیری به کار گرفت. 

به منظور انجام آنالیزهای ژنومی، توالی کامل کرونا ویروس های مورد نظر با شماره های دسترسی برگرفته از بانک ژن یا ابتکار جهانی برای به اشتراک گذاری همه داده های آنفلوآنزا ، از داده پایگاه هایی مانند مرکز ملی اطلاعات زیست فناوری و مرکز منابع بیوانفورماتیک باکتریایی و ویروسی ذخیره و سپس هم ردیفی توالی ها با نرم افزار Workbench CLC Main انجام شد. در مرحله بعد درخت فیلوژنتیک با روش اتصال همسایگی  با 1000 تکرار (Bootstrap) توسط نرم افزار MEGA X ترسیم شد و برای نمایش واضح تر درخت از FigTree نسخه 1.4.4 استفاده شد.

تمام اصول اخلاقی در نوشتن این مقاله طبق دستورالعمل های کمیته اخلاق ملی و مقررات COPE رعایت شده است.

در مطالعه حاضر، جهش ها و نیز تاثیری که ممکن است بر قابلیت انتقال، شدت بیماری زایی و اثربخشی واکسن داشته باشند، ویژگی های مولکولی، اپیدمیولوژی و محل ظهور کرونا ویروس ها با محوریت واریانت های نگران کننده، از جمله آلفا (B.1.1.7)، بتا (B.1.351)، گاما (P.1)، دلتا (B.1.617.2) و امیکرون (B.1.1.529) ارایه شده است.

بروز جهش ها و تکامل مداوم موجب ظهور سریع و هم زمان واریانت های مختلف شده که هر کدام از این تغییرات می توانند بر فرار از روش های درمانی مانند آنتی بادی های خنثی کننده و پلاسمای نقاهتی و همچنین کاهش اثربخشی واکسن ها نقش داشته باشند؛ بنابراین افزایش نظارت برای مستندسازی، درک گسترش دودمان های مختلف و مطالعه دقیق تر این جهش ها در شناسایی واریانت ها و مقابله موثر با آن ها از اهمیت بالایی برخوردار است.