انگشت نگاری ژنتیکی جدایه های باکتری اشریشیا کلی جمع آوری شده از حیوانات باغ وحش کرمان با روش ERIC-PCR

انگشت نگاری ژنتیکی سویه های باکتری اشریشیاکلی در یک زیستگاه می تواند کمک شایانی به درک ما از تنوع ژنتیکی و چرخش آنها در میزبان های مختلف کند. در این مطالعه، تعداد 48 نمونه مدفوع از 24 نوع گونه حیوان سالم در باغ وحش کرمان توسط سوآپ استریل جمع آوری شد. پس از جداسازی اشریشیاکلی، سویه ها با روش ERIC-PCR، انگشت نگاری ژنتیکی شده و الگوی باندهای به دست آمده از الکتروفورز با نرم افزار Gel Quest کالیبره و تجزیه و تحلیل شد. در گام بعد شباهت انواع ERIC با ترسیم درخت فیلوژنتیک توسط نرم افزار Cluster Viz با استفاده از الگوریتم UPGMA نشان داده شد. در این روش با قطع تشابه ≥90 درصد، 22 کلون مورد شناسایی قرار گرفت؛ الگوی ERIC جدایه های کبوتر با یک جدایه از طاووس، همچنین جدایه های شترمرغ با یک جدایه از طاووس، شباهت 100 درصدی داشت. جدایه های مرغ شاخدار، کاسکو و یک جدایه از شاه بوف با شباهت 100درصدی از نظر الگوی ERIC در کنار هم قرار گرفتند. همچنین جدایه های شتر و یک جدایه از شاه بوف شباهت 100 درصدی را در الگوی ERIC از خود نشان دادند. با توجه به اینکه چندین سویه جدا شده از میزبان های مختلف با گونه های متفاوت دارای شباهت 100 درصد در الگوی ERIC بودند، می توان نتیجه گرفت به علت نزدیک بودن این گونه های مختلف حیوانی در یک زیستگاه مانند باغ وحش، باعث شده است که این سویه ها در بین حیوانات مختلف در گردش باشد.