بررسی پروفایل بیانی سلول های روده آلوده به کریپتوسپوریدیوم پارووم با استفاده از بیوانفورماتیک

پاتوژن ها مکانیسم های سلولی میزبان را تحت تاثیر قرار می دهند تا بتوانند توانایی های سلول میزبان را در مسیر عفونت قرار دهند. کریپتوسپوریدیوم پارووم در افراد مبتلا به ایدز و افراد دارای ضعف سیستم ایمنی ایجاد مشکلات صفراوی شدید و اسهال حاد و کشنده می نماید و به عنوان پاتوژن روده ای مهم در انسان و برخی پستانداران شناخته شده و هم ردیف با سالمونلا، شیگلا و سویه های انتروتوکسی ژنیک اشرشیاکلی قرار می گیرد. باید توجه داشت که سلول های روده ی انسان در اثر آلودگی و عفونت با کریپتوسپوریدیوم پارووم دچار تغییرات عمده در فعل و انفعالات میزبان- انگل به خصوص تغییر در بیان ژن های مربوطه می گردد. هدف از انجام این تحقیق شناسایی اثرات تغییر پروفایل بیانی ژن ها در سلول های HCT-8 آلوده به کریپتوسپوریدیوم پارووم بر واکنش متقابل میزبان-انگل بود. در این تحقیق تخمینی از میزان ژن های درگیر در فرایندهای بیولوژیکی و در روند آلودگی سلول های روده به کریپتوسپوریدیوم پارووم به دست آمد. به منظور انجام مطالعات مورد نظر از اطلاعات ثبت شده در پایگاه داده هایGEO در وب سایت NCBI که توسط محققین دانشگاه هوستن تگزاس آمریکا قرار داده شده بود استفاده شد. اطلاعات خام با نرم افزارهای مختلف و با استفاده از پایگاه های اینتزنتی مورد خوانش، پیش پردازش و پردازش قرار گرفتند. در بررسی های انجام شده مشخص شد که بیان ژن های دخیل در آلودگی رده سلولی HCT-8 به وسیله کریپتوسپوریدیوم پارووم تحت تاثیر قرار می گیرند و به طبع آن برخی از ژن ها بیش از حد و برخی از ژن ها کمتر از حد بیان می شوند. نتایج حاصل از این مطالعه نشان می دهد که بیش ترین ژن های درگیر در فرایندهای بیولوژیکی مربوط به ارتباطات سلول - انگل و کم ترین ژن های درگیر در ارتباط با مرگ سلولی(آپوپتوز) و تکثیر DNA می باشند. بررسی نتایج حاصل از این تحقیق نشان می دهد که ژن های مختلفی تحت تاثیر عفونت دچار تغییر در بیان می شوند که هرکدام می توانند موجب فعال شدن عوامل مختلف و مسیرهای متفاوتی در راستای عفونت شوند و به عنوان اهداف دارویی و واکسن در آینده مورد توجه قرار گیرند.