شناسایی SARS-CoV- 2 با تکنیک تکثیر به واسطه ی حلقه ی ایزوترمال معکوس (RT-LAMP)

بیماری کووید-19 یک نگرانی بهداشت جهانی است که نیاز به تست تشخیص سریع کمی دارد. در حال حاضر تکنیک استاندارد برای تشخیص SARS-CoV-2 رونویسی معکوس (qRT-PCR) انجام می گیرد. هدف از این مطالعه طراحی روش حساس (RT-LAMP) LAMP برای تشخیص ویروس SARS-CoV-2 بود.

در این مطالعه آزمایشگاهی نمونه بیماران با استفاده از سواب های حنجره، حلق و بینی تهیه و پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، ویروس SARS-CoV-2 با استفاده از روش RT-LAMP مورد ارزیابی قرار گرفت. بدین منظور از پرایمرهای طراحی شده با هدف قرار دادن ژن های N و E، حساسیت روش RT-LAMP مورد بررسی قرار گرفت.

در این مطالعه 19 نمونه RNA ویروس SARS-CoV-2 مورد بررسی قرار گرفت. نتایج این مطالعه نشان می دهد که برای تشخیص و مشاهده کدورت یا تغییر رنگ فلورسنت و همچنین ژل آگارز الکتروفورز حساسیت بیشتری دارد. برای بررسی تعداد کپی ژن E تست بر روی ژل الکتروفورز آخرین رقت 9-10 و بر اساس نور فلورسنت آخرین رقت قابل  بررسی 8-10 بود که با ژل الکتروفورز 1 کپی و بر اساس فلورسنت 14 کپی را تشخیص می دهد؛ اما در مورد ژن N بر روی ژل تا رقت 10-10 و در اثر نور فلورسنت تا رقت 8-10 قابل بررسی بود که به ترتیب توان تشخیص 1 کپی و 17 کپی را داشتند که با فرمول Chiang محاسبه گردید.

نتایج این مطالعه نشان داد که روش LAMP یک روش ساده، سریع، حساس و خاص که برای تشخیص SARS-CoV-2 است که ممکن است پتانسیل تشخیصی را در آزمایشگاه های بالینی بهبود بخشد.