شناسایی ژن های هاب داروپذیر و مسیرهای کلیدی مرتبط با سرطان دهانه رحم با تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین پروتئین: یک مطالعه in silico

رشد کنترل نشده سلول های غیرطبیعی در دهانه رحم منجر به شروع سرطان دهانه رحم، چهارمین سرطان شایع زنان می شود. تاکنون مطالعات زیادی بر روی سرطان دهانه رحم انجام شده است، با این حال، کشف ژن های هاب، مسیرهای کلیدی و مکانیسم های دقیق ایجاد این بیماری ضروری به نظر می رسد.

هدف از این مطالعه استفاده از الگوهای بیان ژن و آنالیز شبکه برهمکنش پروتیین-پروتیین (PPI) برای شناسایی مسیرهای کلیدی و ژن های هاب داروپذیر در درمان سرطان دهانه رحم می باشد.

در این آنالیز in silico، دو مجموعه داده بیان ژن ریزآرایه GSE63514 (104 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) و GSE9750 (42 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) از سایت (GEO) Gene Expression Omnibus برای شناسایی ژن های مشترک با بیان متفاوت در آنها، استفاده شد. تجزیه و تحلیل مسیر GO و KEGG از طریق پایگاه داده Enrichr انجام شد. پایگاه داده12.0 STRING و پلاگین cytoHubba در نرم افزار 3.9.1 Cytoscape برای ایجاد و تجزیه و تحلیل شبکه برهم کنش PPI به کار برده شد. در نهایت، ژن های هاب داروپذیر غربال شد.

پس از غربالگری شبکه برهم کنش PPI بر اساس degree توسط پلاگین cytoHubba، 10 ژن به عنوان ژن های هاب مرتبط با سرطان دهانه رحم شناسایی شدند که شامل NCAPG، KIF11، TTK، PBK، MELK، ASPM،TPX2 ، BUB1، TOP2A و KIF2C می باشند. در میان این ژن های هاب، 5 ژن (KIF11، TTK، PBK، MELK و TOP2A) داروپذیر هستند.

این تحقیق چشم اندازی جدید برای طراحی اهداف درمانی در بیماران مبتلا به سرطان دهانه رحم ارایه می دهد. با این حال، این یافته ها باید از طریق آزمایش های بیشتر تایید شود.