بررسی شبکه تنظیمی ژن های موثر بر صفات تولید و ترکیبات شیر گوسفند با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی (GWAS)

به منظور بهره گیری از نتایج تحقیقات مرتبط با مطالعات پویش کل ژنومی (GWAS) و استفاده از آن در جهت ترسیم شبکه های تنظیم ژنی، مطالعات جدیدی در حال انجام می باشد که مبنای آن استفاده از الگوریتم های ماتریس AWM است (Reverter و Fortes، 2013). در مطالعه حاضر، شبکه های ژنی از طریق الگوریتم های ماتریسAWM -PCIT و ارتباط SNPها با فنوتیپ های تولید و ترکیبات شیر گوسفند ترسیم شد. بدین منظور از داده های تولید و ترکیبات شیر 469 راس میش نژاد Valle del Belice و اطلاعات ژنوتیپی 37228 SNP استفاده شد. داده های فنوتیپی شامل 5328 رکورد روز آزمایش برای 6 صفت تولید شیر (مقدار تولید، میزان و درصد چربی، میزان و درصد پروتیین و تعداد سلول های بدنی شیر) بود و شبکه تنظیم ژنی با استفاده از برنامه cytoscape رسم شد. نتایج نشان داد که استفاده از الگوریتم های AWM-PCIT از بین ژن های شناسایی موجود، که در ارتباط مستقیم و غیرمستقیم با صفات مرتبط با شیر بودند ژن های OSBPL3، ERBB4، VGLL4، BAZ1A، DDX25، CDH23، ITSN2، DPY30، FAT3 و CAPN10 شناسایی شدند. نتایج مطالعه حاضر و سایر مطالعات نشان داد که فرآیند پیچیده تولید و ترکیبات شیر تحت تاثیر شبکه تنظیم ژنی بیش از 10 ژن مهم و ارتباط با تعداد زیادی از ژن های دیگرقرار دارد و با توجه به تایید نتایج حاصل از مطالعه قبلی در زمینه ی پویش ژنومی صفات تولید و ترکیبات شیر، و شناسایی مناطق ژنومی جدید مرتبط با این صفات، استفاده از یافته های این تحقیق، می تواند در انتخاب ژنتیکی گوسفند مفید باشد.