طراحی واکسن سودوموناس آئروژینوزا متمرکز بر پروتئین های غشای خارجی با استفاده از واکسن شناسی معکوس

  مقاومت آنتی بیوتیکی به عنوان یک تهدید بزرگ برای سلامت جهانی شناخته شده است که می تواند منجر به افزایش عوارض و مرگ و میر شود. در 27 فوریه 2017، اولین فهرست پاتوژن های اولویت دار مقاوم به آنتی بیوتیک توسط سازمان بهداشت جهانی (WHO) منتشر شد. این پاتوژن ها، از جمله سودوموناس آئروژینوزا، بزرگترین تهدید را برای سلامت انسان به همراه دارند. این تحقیق به منظور معرفی پروتئین های مناسب کاندید واکسن علیه پروتئین های غشای خارجی سودوموناس آئروژینوزا (OMPs) با استفاده از رویکرد واکسینولوژی معکوس انجام شد.

  پنجاه و هشت ایزوله بالینی و 9982 توالی پروتئین غشای خارجی برای بررسی ویژگی های مشتق شده از توالی در Vaxign2 استخراج شدند. ابتدا 30 پروتئین با بیشترین احتمال چسبندگی انتخاب شدند و در مرحله بعد 10 کاندید مشترک از بین 58 سویه با بالاترین امتیاز به عنوان کاندیدای مطالعات بیشتر معرفی شدند. پس از تعیین ویژگی های فیزیکوشیمیایی این واکسن های کاندید، وجود دامنه های محافظت شده در 2 پروتئین از 10 پروتئین پیش بینی شد.

  بر اساس نتایج به دست آمده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک خواص آنتی ژنی این پروتئین ها، ما 10 پروتئین غشای خارجی را شناسایی کردیم که دارای بالاترین امتیاز آنتی ژنی هستند، در بین 58 ایزوله بالینی مشترک هستند. هیچ همولوگ پروتئین انسانی ندارند و کمتر از 1 مارپیچ گذرنده دارند. این پروتئین های کاندید خواص فیزیکوشیمیایی مطلوبی دارند. و حضور دمین های حفاظت شده فقط در غشای خارجی پورین F و گیرنده آهن انتروباکتین پیش بینی شد.

  ما 10 پروتئین کاندید را پیشنهاد کردیم از جمله پروتئین غشای خارجی F ((OprF و گیرنده انتروباکتین فریک که ویژگی های مناسبی را نشان دادند.