کاربرد مقایسه ای الگوهای PCR-RFLP مناطق ITS و ژن 5.8S در تاکسونومی قارچ های اندوفیت Neotyphodium

در این پژوهش قارچ های اندوفیت از غلاف برگ و بذرها میزبان های گیاهی Melica persica، Bromus tomentellus، Festuca ovina، F. pratensis، F. arundinacea و Lolium prenne جداسازی گردید. پس از استخراج DNA ژنومی این جدایه ها به منظور تایید حضور گونه های اندوفیت از سه جفت آغازگر، IS1/IS3، ITS1/ITS4 و 111/112 استفاده گردید. نتایج حاصل از PCR با این سه جفت آغازگر نشان داد که اکثر جدایه های مورد استفاده در این پژوهش از گروه قارچ های اندوفیت و از جنس Neotyphodium و جدایه های مربوط به arundinacea Festuca متعلق به گونه N. coenophialum بودند. برای تکثیر نواحی ITS1 و ITS2 و ژن 5.8 S از آغازگرهای ITS1 و ITS4 استفاده شد و سپس برش آنزیمی به وسیله آنزیم های محدودگر Sau3AI و CfoI انجام گرفت. نتایج PCR-RFLP نشان داد که جز در چند مورد، نتایج حاصل از هضم آنزیمی با نتایج حاصل از بررسی خصوصیات مورفولوژیکی و انجام واکنش PCR با سه جفت آغازگر مذکور همخوانی داشت.